景观片段化被证明对景观生境内生物多样性产生重要的影响。千岛湖是由蓄水而导致的典型片段化景观,为了探究片段化情况下生物的遗传多样性受到的影响,本文利用线粒体DNA COI基因片段序列作为分子标记,对采自千岛湖地区23个样岛的马尾松毛虫种群的遗传多样性进行了研究,结果表明:23个种群共检测到141个单倍体型,其中单倍型Hap3和单倍型Hap8分布最广;23个种群遗传多样性水平较高,单倍型多样性的值在0.85375~0.98268之间,Tajima’s D检验表明马尾松毛虫种群近期未经历显著的瓶颈效应和定向选择;通过遗传多样性与岛屿属性的回归分析表明,松毛虫遗传多样性与岛屿面积和岛屿形状呈显著正相关关系,与岛屿隔离距离(距最近岛屿的距离)无相关性;23个松毛虫种群成对遗传分化系数Fst的值在0.00025~0.18805之间,种群间遗传分化程度较低,达到较高分化程度的比例仅为1.98%,中等程度遗传分化的比例为17.39%,其余种群间不存在遗传分化;遗传距离与岛屿间地理距离的回归分析表明,两者不存在显著的相关关系;分子变异分析结果表明,I33号岛屿马尾松毛虫种群与其余岛屿种群分为两组时,组间有显著遗传结构存在,种群内的遗传变异占总变异的89.71%,是千岛湖地区马尾松毛虫种群遗传变异的主要来源;单倍型系统树和单倍型网络图的结果表明,各单倍型间无显著的遗传结构。