随着改革开放以来我国综合国力的增强,对国防科技的发展也越来越关注。军工科研院所（简称军工所）作为国防科技发展与创新的中坚力量,承担着国防武器装备开发设计、促进国防科技进步的重要使命,其发展也备受瞩目。科研人员是军工所的核心。在国家大力推行军工所分类转制的背景下,军工所科研人员面临着重大的机遇和挑战。绩效考核是人力管理中一项十分重要的环节,在实现组织的战略目标中起着重要的作用。有效的绩效考核体系能够将员工的主观性和创造性发挥到最大限度,并提高整个组织的绩效水平。军工所原有的科研人员绩效考核体系已经不能适应行业形势发展的需要,如何提高科研人员的热情,激发创造力,保持科研队伍活力是分类转制期军工所面临的一个难题,构建一套适用于分类转制期军工所科研人员的绩效考核体系已成为当前工作的重点。本文运用案例分析法,以F军工所为例,阐述了F军工所科研人员的特点,总结了科研人员绩效考核体系现状和现有问题,并以分类转制为背景,分析了军工所面临的机会和挑战。首先,通过分析选取合适的绩效考核方法,根据F军工所科研人员实际情况,确定关键绩效指标。第二,运用层次分析法,对指标权重值进行分析及计算。最后,提出相关的保障措施,完成了F军工所科研人员绩效考核体系优化。通过全文的论述,本研究解决了分类转制期F军工所科研人员绩效考核存在的几个突出问题,如考核内容不全面,考核指标缺乏科学性,考核意识淡薄以及对考核结果没有反馈等,并提出了自己的意见和建议。本研究主要的创新点在于,结合当前军工所推行分类转制和军工科研人员自身的特点,以F军工所为例,为优化科研人员绩效考核体系,采用KPI和AHP相结合的方法来完善F军工所科研人员绩效考核体系。不仅提高了科研人员对工作的热情,激发了科研人员的科研创新能力,而且在分类转制期同类军工所科研人员绩效考核体系设计中具有一定的借鉴意义。