家蚕二分浓核病毒BmBDV非结构蛋白NS2的未知功能探索

来源 :江苏大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:aionkina
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
家蚕二分浓核病毒(BmBDV)在报道之初被划分于细小病毒科浓核病毒亚科,而由于其独特的基因组结构,国际病毒分类委员会于2012年将其归类至新设定的二分DNA病毒科二分浓核病毒属,目前BmBDV也是二分DNA病毒科中的唯一成员。家蚕二分浓核病毒能够引起家蚕患浓核症,对家蚕养殖业造成了较大的经济危害。目前该病毒的基因组结构及转录机制已经有了较为全面的报道,但病毒的复制机制、各非结构蛋白功能,以及病毒衣壳的3D结构都尚不明确。研究表明非结构蛋白在病毒的感染及复制周期中起着重要的作用,目前仅对序列相对保守的非结构蛋白NS1的功能有较为详尽的报道,而针对NS2、NS3的研究则较少,鉴于非结构蛋白功能的研究对阐明病毒的复制机理至关重要。本课题以BmBDV的非结构蛋白NS2为研究对象,从蛋白的细胞定位、对各基因启动子活性影响、以及互作蛋白分析三个方面对这一蛋白的功能进行初步的探索。我们首先利用生物信息学软件对包括BmBDV在内的所有已报道的无脊椎动物ssDNA病毒非结构蛋白NS2氨基酸序列进行分析,并建立了系统进化树。系统发生分析表明无脊椎动物ssDNA病毒的NS2在进化分支上与目前的分类较为接近,且同属内的病毒聚集在一支,提示NS2可能在同属内功能较为保守,而BmBDV NS2在进化上靠近Hamapavovirinae亚科。由于BmBDV的NS2蛋白在体外表达时定位于Bm N细胞的细胞核内,且软件分析表明在蛋白的C端存在一个潜在的二分型核定位信号结构域。同时我们也在细胞水平验证了JcDV等其他昆虫ss DNV病毒的NS2蛋白定位,发现均定位于细胞核内,但氨基酸序列中并不具备经典的NLS结构域。因此我们也同时对无脊椎动物ssDNA病毒非结构蛋白NS2的NLS进行了分析,结果表明各病毒的NS2蛋白可能都包含有非经典的NLS结构域,且序列及定位在同一属内较为保守。我们猜测在无脊椎动物ssDNA病毒中NS2蛋白的核定位信号结构域可能有着独特的排列规律,以此保证NS2蛋白在功能上的保守性。基于预测结果,我们构建了重组BmBDV NS2融合e GFP表达载体(p Fastie1-NS2-e GFP),通过对核定位信号预测区域的截短突变表确认了该潜在NLS结构域的功能性,进而通过单点/多点突变鉴定了NS2的关键氨基酸,结果表明BmBDV的NS2蛋白C端具备一个二分型NLS结构域,而这一NLS的组合规律为:(R)KR(K)X10-12K3/5,X代表任意氨基酸,括号中碱性氨基酸需任留一个。无脊椎动物ssDNA病毒的NS2蛋白在细胞核定位上具有保守性,提示这一蛋白很可能在病毒的复制和转录过程中发挥着重要作用。为了探索NS2蛋白对病毒其他基因在转录过程中是否具有调控作用,我们构建了BmBDV中所有基因的启动子重组质粒以及NS2蛋白过表达质粒,通过荧光素酶表达系统分析启动子质粒单独转染或与NS2表达质粒共同转染Bm N细胞后的荧光素酶活性,分析NS2过表达对病毒各基因启动子活性的影响。结果表明,NS2能够促进NS3的启动子活性并且能够抑制VP的启动子活性,对其他基因的启动子活性没有调控作用。推测NS2可能在感染后期抑制VP的表达并提高NS3的表达,与NS3共同促进病毒粒子的组装及子代病毒粒子的释放。为了筛选宿主细胞中可能与NS2存在互作的蛋白,我们使用杆状病毒表达系统,将BmBDV NS2连接His标签,并构建重组Bacmid(Bacmid-Ie1-e GFPp5.5-NS2-His),转染细胞后获取了重组杆状病毒,注射家蚕后将患病家蚕的中肠,使用Co-IP及LC-MS/MS技术对NS2的互作蛋白进行了分析后,共得到1088个特异性蛋白,其中一半以上的蛋白都有着两个以上的唯一肽段匹配数。这些特异性蛋白主要包含与免疫相关的载脂蛋白、热激蛋白;在病毒复制方面具功能的翻译延伸因子;在家蚕中肠有消化作用的氨基肽酶;以及在浓核病毒VP含有的介导病毒进入细胞的磷脂酶A2。同时我们在互作蛋白中也发现了某些具核转运功能的蛋白,提示后续可从NS2功能与核转运蛋白的相互关系出发研究NS2在病毒入核和出核转运中的功能。综上所述,我们对BmBDV NS2的功能进行了初步研究。研究表明NS2定位在细胞核内,且具有独特的核定位信号,该蛋白可能在病毒基因复制中发挥作用;NS2可能具有调控NS3及VP启动子活性的功能;同时,我们初步分析了NS2在家蚕中肠中的互作蛋白。这些对BmBDV的NS2蛋白功能的初探结果对进一步的深入研究提供了数据支持,同时也对全面解析该病毒的复制机制奠定了理论基础。
其他文献
当前,高职院校艺术设计专业专业培养方案中,针对学生就业能力方面的内容存在片面性、滞后性,从而导致学生的就业能力一直处于相对缺失的状态。因此,这就需要教师采取多元化的教学策略,有效提升高职艺术设计专业学生就业能力。
企业的数字化转型主要内涵是以信息技术为核心工具,对其数字化功效进行深度挖掘和利用,而数字化技术的应用并非只在企业的生产经营以及营销方面,在企业财务管理和监督领域,数字化技术同样有巨大的应用空间。
竖缝式鱼道因其能够适应不同水位变化、消能效果明显、水流流态稳定等特点而逐渐引起水利工程界的重视。通过数值模拟的方法探究了池室长宽比对异侧式竖缝鱼道水力特性的影响,结果表明,池室长宽比的变化对单位体积耗散率影响较小;主流区沿程衰减率先随池室长宽比的增大而增大,后保持不变。池室长宽比越大,池室内最大流速越靠近竖缝处;不同池室长宽比,池室主流流速与池室最大流速(主流流速沿程变化最大值)比值在一定范围内。
VIE架构是一种通过协议控制境内运营实体实现境外上市的融资模式。长期以来,我国对于内地企业采用VIE架构赴港上市的监管并未明晰,总体而言态度开放。但随着相关法律法规及政策的出台,我国对VIE架构监管不断加强,VIE架构优势削弱、法律地位动摇。加之VIE架构自身以协议为运行基础、引入外资等特殊性,VIE架构存在极大的合法性风险、违约强行拆除风险及恶意避税风险,造成我国经济社会的不稳定和税源的流失。因
文章首先简要概述了会计信息化的有关概念;其次就会计信息化在企业财务管理中的影响进行了分析(正面/负面);最后提出了会计信息化在企业财务管理中的应用措施。其中包括更新财务管理理念;加强风险管理;开发信息化管理工具,结合大数据创新企业财务管理办法;更新财务管理目标等。
目的:在全国全面推进安宁疗护试点的背景下,通过层次分析法构建中观层面的安宁疗护服务质量和效果评价指标体系并量化权重系数,为试点综合评价提供科学工具。方法:依托“结构—过程—结果”框架,在前期研究基础上运用层次分析法科学计算指标体系各维度指标(3个一级、9个二级、25个三级和81个四级指标)权重系数。结果:结构权重(0.38)高于过程(0.30)和结果(0.32);结构维度中机构制度保障(0.14)
在历史建筑的绿色改造方面,欧美国家积累了一系列先行理论与实践经验,并为亚洲国家的相关发展提供了国际背景。马来西亚槟城琼崖海棠酒店与中国武汉平和打包厂的绿色可持续保护与改造再利用项目不仅是亚洲不同国家在此领域中所获成绩与现实发展状况的缩影,也可供亚洲各国相互学习借鉴。
<正>作为社工站负责儿童服务板块的社工,笔者经常为学龄期儿童及其家庭开展各项服务。根据服务经验和需求调研,社工了解到很多家庭都有家庭教育、家长成长和儿童能力提升的需要,而在针对这些需求开展服务时,改善家庭关系是达成目标的重要步骤。在开展家庭关系个案辅导过程中,社工团队整编出一套家庭关系辅导工具(下称辅导工具),包含家庭会议、家庭作业、家庭行为约定书等,社工将每个工具的操作具体化,加上了目的和操作指
期刊
大数据时代的到来使得我国不少企业逐渐开始对自身工作业务进行信息化改革。不少数字化管理理念及技术也随着企业信息化进程的迅猛发展而得到了更进一步的构建,包括不少企业财务管理工作也同时对此类信息化管理理念进行了合理运用。但我国大多数中小型企业信息化建设工作比较落后,其所沿用的财务管理模式也具有较大局限性。因此,中小企业要想在大数据时代背景中,对财务数字化转型工作进行真正落实,其必须要对自身财务管理问题进
研究基于BIM的地铁车站机电设备维修管理系统设计,梳理维修管理系统的基本需求及目标定位,根据地铁车站机电设备维修管理作业主要内容,重点分析系统的信息需求并总结其总体设计手段及方法,并设计系统功能模块内容。通过实施基于BIM的机电设备维修管理系统,实现地铁车站机电设备的可靠维护管理。