目的 结直肠癌（Colorectal cancer,CRC）为常见的恶性肿瘤之一,本文探究表观遗传修饰相关基因,研究其与CRC临床病理因素及预后的关系,并对表观遗传修饰相关基因进行验证。方法 1.利用Limma和Cytoscape软件对TCGA-COAD和TCGA-READ数据库筛选CRC表观遗传修饰相关基因,使用DESeq2分析TCGA-COAD和TCGA-READ数据库中差异表达的表观遗传修饰相关基因。2.利用LASSO Cox回归分析表观遗传修饰相关基因的CRC诊断和预后,通过绘制预测1年、3年和5年生存率的列线图验证CRC的诊断和预后。3.采用单因素和多因素Cox分析对CRC表观遗传修饰相关基因（epigenetic modification related genes,ERGs）的临床独立危险因素进行分析。4.采用基因集变异分析（gene set variation analysis,GSVA）基于hallmark基因集对ERGs进行功能预测分析。5.利用GEPIA数据库对ERGs基因的表达及生存进行分析。6.采用肿瘤药敏基因组学（Genomes of Drug Sensitivity in Cancer,GDSC）数据库对 ERGs 的药物敏感性进行分析。7.利用免疫组化对ERGs在CRC肿瘤组织及癌旁组织中进行回顾性分析验证。结果 1.在TCGA-CRC数据集中共发现了 335个差异表达ERGs,并通过Cox分析TCGA临床数据得到26个CRC预后相关的ERGs,基因本体（Gene ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto gene and genome encyclopedia,KEGG）富集到参与RNA干扰的siRNA的过程、正调控的蛋白乙酰化、β-catenin-TCF复合物、正调控的肽基赖氨酸乙酰化以及耐药的铂类药物等通路上。2.利用LASSO Cox回归分析筛选出5个具有较佳 CRC 预后价值的基因 CCDC114、CELF4、PPARGC1A、PTRH1 和 TCF7L1;分析 CRC 诊断和预后:risk score=0.0199*CCDC114+0.0065*CELF4-0.0346*PPARGC1 A+0.0076*PTRH1+0.0425*TCF7L1,并且生存分析CRC中中位预后表观遗传风险评分（prognostic epigenetic risk score,PERs）高的组与较短总生存时间具有显著相关性;同时,CRC诊断和预后模型的检验显示3年和5年生存率的预测和实际结果重合度较高,模型较理想。3.采用单因素Cox分析表明5个ERGs的特征与不良总生存期显著相关,多因素Cox分析证实5个ERGs特征均是CRC患者总生存期的独立危险因素,且其他临床病理参数也与CRC患者预后不良相关,包括阶段分期,N分期,M分期,T分期和淋巴侵犯。4.GSEA分析结果显示高Pers组在霍尔标记顶端连接、霍尔标记Kras signaling Dn、霍尔标记心肌再生和霍尔标记Wnt/beta信号等通路显著富集。5.通过GEPIA数据库和GSE39582数据集分析显示CCDC114和PTRH1在CRC肿瘤组织中表达上调,PPARGC1A在CRC肿瘤组织中表达下调。并且GEPIA生存分析显示ERGs中PPARGC1A、CCDC114与CRC患者预后具有显著关联性,而CELF4、TCF7L1和PTRH1对CRC患者预后几乎无影响。6.此外,GDSC分析得出与ERGs表达敏感性相关的药物有KIN001-055、JQ1、VX-702、Lenalidomide、OSI-027、Vinblastine、Dasatinib、SB216763、BMN-673、AV-951、STF-62247、BMS-345541 和 KU-55933。7.最后,通过免疫组化实验验证了 CCDC114和PTRH1在CRC中高表达,且PPARGC1A在CRC中低表达。结论 获得3个结直肠癌诊断和预后相关的表观遗传修饰基因,可为CRC患者临床诊断及预后情况提供指导,CCDC114、PTRH1和PPARGC1A可作为CRC预后相关的表观遗传修饰生物标志物。