21世纪,是科技的时代,是技术的时代。一个企业乃至一个国家的经济增长对于自然资源和资本资源的依赖程度逐渐减弱,智力资源从众多资源中脱颖而出,成为企业竞争和国际竞争的焦点。我国为了促进高新技术的发展,对高新技术企业的技术创新项目投入了大量的人力、物力以及财力,但在投入的同时,必然带来了一个重要的问题：如何对技术创新投入的绩效状况进行更准确的审计。在各国家对高新技术企业技术创新投入大量财政资金和多项优惠政策的同时,如何规避和降低技术创新风险成为了创新研究的热点之一。然而,我国高新技术企业技术创新绩效审计尚处于探索阶段,主要是借鉴英国学者齐萨(Chiesa)绩效审计模型、欧洲“奥斯陆手册”等相关的指标体系进行实践工作,在如何制定更加适合我国技术创新绩效审计的具体评价指标体系方面,尚未得到一致的认可。这些问题逐渐成为理论界和实务界共同关注的焦点,并迫切需要对此问题加以解决。本研究在对国内外高新技术企业绩效审计相关文献进行回顾和总结的基础上,引入熊彼特创新理论、公共受托责任理论、新公共管理理论、多层次理论以及行为整合理论作为全文的理论支撑。首先,本研究通过问卷调查的方式了解我国高新技术企业技术创新绩效审计评价指标体系的运用现状以及所存在的问题,并利用本次问卷调查,从侧面了解了绩效审计工作人员对于推进我国绩效审计指标体系进一步完善的建议。其次,以多家已在我国上市的高新技术企业作为研究对象,选取了这些上市的高新技术企业的技术创新项目为研究样本,先后通过提出假设条件、选取相关变量、构建并验证绩效审计模型,最终得出一套新的适合我国使用的高新技术企业技术创新绩效审计评价指标体系：最后,本研究针对于在第三部分的调查问卷中发现的绩效审计指标体系中存在的问题,分别从宏观角度和微观角度提出了推进我国绩效审计质量的有效对策,为我国绩效审计的更有力实施提供了一定的借鉴与启示。