加权基因共表达网络分析挖掘急性髓系白血病相关致病基因

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急性髓系白血病(AML)是一种造血干细胞恶性增殖引起的血液肿瘤,在我国以及全球都有着高发病率和高死亡率。作为一个高异质性疾病,筛选合适的预后因子对精准治疗AML来说十分重要。本研究中,我们通过对TCGA数据库中的急性髓系白血病数据进行加权共表达基因网络分析(WGCNA),筛选与AML临床信息显著相关的基因模块,并且进一步探究这些模块中基因的功能和意义。最终我们从16个模块中找到一个与临床信息最显著相关的包含289个基因的模块,该模块中最重要的枢纽基因为HOXA家族中的HOXA6基因。关于HOXA家族与AML的相关性已经被许多文献证实,但是关于HOXA6与AML之间的关系尚不明确。我们通过统计学方法研究,发现HOXA6的高表达与FAB分型以及NPM1基因突变相关,结果表明HOXA6在AML中高表达可能与预后不良有关。本研究将WGCNA应用于探索AML相关基因的研究,为找到AML不良预后相关因子奠定了基础,证明了HOXA家族基因在白血病中的作用,也为我们了解AML的分子机制提供了新的依据。
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