福建与台湾一衣带水，自然条件相似，人文相通，渊源的历史推动力和血浓于水的感召力使闽台农业合作在两岸交往中一枝独秀，福建农业利用台资总额在全国各省、市、自治区中名列前茅。 本文运用区域经济学、发展经济学、农业经济学和计量经济学等多学科理论，定量分析和定性分析相结合，辅之以必要的比较分析法，剖析了闽台农业合作的发展历程、模式和存在的问题。创新点在于对闽台农业合作效应的实证分析。并以漳台农业成功合作为案例，阐明了台湾农业资金和技术对福建农业现代化的促进作用。台湾农业在资本、品种引进、技术水平、农业科技和管理人才等方面具有比较优势；而福建背靠祖国大陆，人多地大，在市场需求、劳动力、土地资源和开发前景上具有较大优势。两地农业合作具有互补性，要素替代理论、技术差距理论、产品生命周期理论和农业区域理论等都可以在闽台农业合作发展中得到应用和体现。现阶段，与台湾农业合作历史最长的、发展势头最好的是漳州和福州等地区，但是，闽台农业合作近两年呈以漳州、福州为中心，以各种方式逐渐向福建全省乃至全国各地辐射的发展态势，这与佩鲁等的中共享心—外圈发展模型和杜能的农业区域理论相一致。 本文探索了福建加快实现农业现代化的途径，提出了发展有福建特色的外向型农业的观点。最后本文具体提出了深化闽台农业合作，推进福建农业现代化进程的思路和对策，即农业合作化、产业化、科技化、特色化和国际化，并预测福建在新世纪初将跻身于农业现代化的行列。