陆地棉RIL群体中多环境稳定的纤维品质性状的QTL定位

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 2次 | 上传用户:xxx555xxx777
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
棉花是世界上重要的天然纤维作物,纺织工业技术的改进要求育种者提供具有优质纤维性状的新品种。通过传统育种方法改良棉花纤维品质是重要的方法之一,但传统育种方法费力,耗时长。如果将传达室统育种方法与分子标记辅助选择相结合,可以更快地实现改良纤维品质的目标。在分子标记辅助选择中,主要是选择与目标QTL紧密相连的分子标记。为促进分子标记辅助选择,就需要定位能稳定表达的QTL,而遗传连锁图谱的构建又是进行QTL定位的前提条件。在近期的研究中,很多科研学者,利用不同群体对棉花品质性状进行了QTL定位。但陆地棉种内的QTL会更有利于分子标记辅助选择的应用。棉属总共包含有四个栽培亚种,分别是二倍体的非洲棉,亚洲棉和四倍体的陆地棉,海岛棉。而亚洲棉和雷蒙德氏棉分别提供了陆地棉的A基因组和D基因组。在最近的报道中显示,陆地棉的Dt基因组比At基因组具有更多的与纤维品质相关的QTL,所以,我们选择棉花D基因组开发SSR标记,进行纤维品质性状的QTL定位。在本次研究中,我们利用亲本0-153和sGK9708构建RIL群体,进行遗传图谱的构建以及棉花纤维品质性状的QTL定位。我们共利用了15203个SSR标记(其中包括12560个基于D基因组序列信息的SSR标记)在亲本之间筛选多态性。所有具有多态性的SSR引物,用于对196个重组自交系进行基因分型。最后,总共获得505个标记,604个位点用于遗传图谱的构建,其中,395个标记总共被分成了60个连锁群,该图谱的总遗传距离为2034.95cM,覆盖了整个陆地棉基因组的百分之五十。利用这张图谱和11个环境的表型数据对于纤维品质性状进行QTL定位,总共115个QTL被定位到20条染色体上,其中,33个QTL被定位到At组染色体上,82个QTL被定位到Dt组染色体上。其中,4号,14号,25号染色体相比其他染色体具有更多的QTL,2号,8号,9号,17号,18号,26号染色体上没有QTL。在4号,7号,10号,14号,21号,25号染色体上具有QTL成簇分布的现象。共有78个QTL定位在这些成簇分布区。27个QTL能够在两个及以上环境中被检测到,有7个与纤维长度相关,6个与纤维强度相关,4个与纤维伸长率相关,3个与纤维整齐度相关,7个与马克隆值相关在前期的研究中,本课题组利用相同的RIL群体分别构建了两张遗传连锁图谱,各覆盖棉花基因组百分之三十,我们的第二步研究中,对前两个连锁图的SSR标记与我们的结果进行整合,构建了高密度遗传图谱并进行了纤维品质性状的QTL定位。在最终的图谱中,总共有997个标记,总遗传距离为4110cM,平均遗传距离为5.2 cM。该遗传图谱覆盖陆地棉基因组的百分之93.2。利用该遗传图谱和11个环境的表型数据对该RIL群体进行了纤维品质性状的QTL定位,总共有165个QTL被检测到,在Dt基因组共有107个,At基因组共有58个。其中,47个为稳定QTL,可以在3个环境及以上被检测到。103个QTL在30个QTL成簇分布区。其中,16个QTL成簇分布区在At基因组,14个QTL成簇分布区在Dt基因组。4号,7号,14号,25号染色体上具有较多的QTL成簇分布。利用Biomercator v4.2进行META分析,其中,90个QTL在其他的研究中也被检测到,75个则为新发现的QTL。META分析显示4号,7号,14号,25号染色体具有更多的QTL成簇分布区,这对于分子标记辅助标记育种,改良棉花纤维品质具有一定的促进作用。11个环境的纤维品质数据都符合正态分布,纤维伸长率的遗传力最低,为0.27,纤维长度遗传力最高,为0.93。纤维强度为0.92,马克隆值为0.85,纤维整齐度为0.80。高遗传力说明该群体QTL定位结果会对分子标记辅助育种更为可靠。多环境鉴定数据以及Meta分析更有助于获得真实稳定的QTL。另外,本研究所用的群体为陆地棉种内重组自交系群体,因而其定位出的QTL更可以真接用于陆地棉育种中的分子标记辅助选择。
其他文献
建设工程价款优先受偿权的期限问题直接关系着权利人可否行使权利、应如何行使权利,是权利人把握权利、合理行使权利的关键。目前能找到的关于建设工程价款优先受偿权期限问
目的:观察连翘水煎液对小鼠胃肠动力的影响。方法:采用传统的小鼠胃排空和小肠推进实验,以多巴胺(Dopamine,DA)、肾上腺素(Adrenaline,Adr)、阿托品(Atropine,Atr)和新斯的明
秀珍菇作为一个新兴菇品,深受市场欢迎,但是由于人们对它生长习性和栽培管理技术认识的不尽透彻,在出菇过程中经常出现菌袋霉烂、出黄水、不出菇、出菇不齐以及萎缩死菇等异常现
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
文章对EPON技术使用初期实行的网络改造进行了介绍,分析了HFC和EPON之间的网络融合方式,利用了新型的技术实现了网络设备的可用性功能发挥。在新老技术的结合下,达到了有线网
针对不完备信息处理问题,分析了不完备信息的语义解释,将粗糙集理论中处理不完备信息的技术策略归纳为数据补齐法和模型扩展法两类。在对已有典型粗糙集扩展模型的定义及其优缺
肺动脉高压是先天性心脏病最常见的并发症,导致先天性心脏病手术风险明显增高,病死率达4.9%~29.0%。本文综述了近年来国内外先天性心脏病合并肺动脉高压的诊疗进展,以期为临
中国共产党成立90多年来,集中教育贯穿中国共产党从领导人民革命的党转变为领导人民有效治理国家的党的全过程。通过梳理集中教育的历史变迁,可以观察到其经过了从肃反到延安
甘蓝型油菜隐性核不育系,以其败育完全、不育性稳定、细胞质丰富等优点,已经成为油菜杂种优势利用的重要途径之一。在植物生长发育过程中,多酶复合体或者代谢区室扮演着重要