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棉花是世界上重要的天然纤维作物,纺织工业技术的改进要求育种者提供具有优质纤维性状的新品种。通过传统育种方法改良棉花纤维品质是重要的方法之一,但传统育种方法费力,耗时长。如果将传达室统育种方法与分子标记辅助选择相结合,可以更快地实现改良纤维品质的目标。在分子标记辅助选择中,主要是选择与目标QTL紧密相连的分子标记。为促进分子标记辅助选择,就需要定位能稳定表达的QTL,而遗传连锁图谱的构建又是进行QTL定位的前提条件。在近期的研究中,很多科研学者,利用不同群体对棉花品质性状进行了QTL定位。但陆地棉种内的QTL会更有利于分子标记辅助选择的应用。棉属总共包含有四个栽培亚种,分别是二倍体的非洲棉,亚洲棉和四倍体的陆地棉,海岛棉。而亚洲棉和雷蒙德氏棉分别提供了陆地棉的A基因组和D基因组。在最近的报道中显示,陆地棉的Dt基因组比At基因组具有更多的与纤维品质相关的QTL,所以,我们选择棉花D基因组开发SSR标记,进行纤维品质性状的QTL定位。在本次研究中,我们利用亲本0-153和sGK9708构建RIL群体,进行遗传图谱的构建以及棉花纤维品质性状的QTL定位。我们共利用了15203个SSR标记(其中包括12560个基于D基因组序列信息的SSR标记)在亲本之间筛选多态性。所有具有多态性的SSR引物,用于对196个重组自交系进行基因分型。最后,总共获得505个标记,604个位点用于遗传图谱的构建,其中,395个标记总共被分成了60个连锁群,该图谱的总遗传距离为2034.95cM,覆盖了整个陆地棉基因组的百分之五十。利用这张图谱和11个环境的表型数据对于纤维品质性状进行QTL定位,总共115个QTL被定位到20条染色体上,其中,33个QTL被定位到At组染色体上,82个QTL被定位到Dt组染色体上。其中,4号,14号,25号染色体相比其他染色体具有更多的QTL,2号,8号,9号,17号,18号,26号染色体上没有QTL。在4号,7号,10号,14号,21号,25号染色体上具有QTL成簇分布的现象。共有78个QTL定位在这些成簇分布区。27个QTL能够在两个及以上环境中被检测到,有7个与纤维长度相关,6个与纤维强度相关,4个与纤维伸长率相关,3个与纤维整齐度相关,7个与马克隆值相关在前期的研究中,本课题组利用相同的RIL群体分别构建了两张遗传连锁图谱,各覆盖棉花基因组百分之三十,我们的第二步研究中,对前两个连锁图的SSR标记与我们的结果进行整合,构建了高密度遗传图谱并进行了纤维品质性状的QTL定位。在最终的图谱中,总共有997个标记,总遗传距离为4110cM,平均遗传距离为5.2 cM。该遗传图谱覆盖陆地棉基因组的百分之93.2。利用该遗传图谱和11个环境的表型数据对该RIL群体进行了纤维品质性状的QTL定位,总共有165个QTL被检测到,在Dt基因组共有107个,At基因组共有58个。其中,47个为稳定QTL,可以在3个环境及以上被检测到。103个QTL在30个QTL成簇分布区。其中,16个QTL成簇分布区在At基因组,14个QTL成簇分布区在Dt基因组。4号,7号,14号,25号染色体上具有较多的QTL成簇分布。利用Biomercator v4.2进行META分析,其中,90个QTL在其他的研究中也被检测到,75个则为新发现的QTL。META分析显示4号,7号,14号,25号染色体具有更多的QTL成簇分布区,这对于分子标记辅助标记育种,改良棉花纤维品质具有一定的促进作用。11个环境的纤维品质数据都符合正态分布,纤维伸长率的遗传力最低,为0.27,纤维长度遗传力最高,为0.93。纤维强度为0.92,马克隆值为0.85,纤维整齐度为0.80。高遗传力说明该群体QTL定位结果会对分子标记辅助育种更为可靠。多环境鉴定数据以及Meta分析更有助于获得真实稳定的QTL。另外,本研究所用的群体为陆地棉种内重组自交系群体,因而其定位出的QTL更可以真接用于陆地棉育种中的分子标记辅助选择。