近年来资源能源的枯竭日益成为制约我国经济发展和社会进步的关键因素。能源安全和能源可持续发展业已成为关乎国计民生的重大问题，尤其是2010年我国的石油对外依存度更是达到了55%左右，远超50%的国际警戒线，石油安全已十分严峻。石油作为车用燃料，对其进行替代来解决短期内可能产生的国家能源危机，比整体能源的替代具有更重要的位置和急切的紧迫性。本文通过对石油产品与各替代能源的比较分析，发现甲醇作为替代能源中的一种，其优异性能已经经过多次理论评价和实践证明，但由于评价指标体系与传统汽油、柴油相比还不够完善和可比性不强，使得政府和应用行业在这么成熟的基础上仍然没有做到规模替代，本文从国家能源安全和国家能源可持续发展的角度出发，以经济、环境、技术、社会、安全五个角度为切入点，分析各级影响因子，研究构建了替代燃料综合评价指标体系，通过层析分析法和专家咨询法相结合来确定各级指标权重，由模型运算对各主要替代燃料进行比较分析，发现甲醇替代燃料具有较明显的比较优势，以让大家了解甲醇替代的重要性和可行性来解决短期内可能发生的国家能源安全问题。并就甲醇替代燃料行业发展中存在的问题，对其进行分析和战略发展研究，以促进其良性发展机制的形成。