背景：乙型肝炎病毒(HBV)耐药突变可在慢性HBV感染患者自身特异性免疫反应压力下发生,并在核苷(酸)类似物治疗过程中出现。以往多数研究结果,显示未经核苷(酸)类似物抗病毒治疗的慢性HBV感染患者体内存在着不同程度的HBV自然耐药突变株。目的：本研究的目的在于采用不同的方法检测并分析未经核苷(酸)类似物治疗慢性HBV感染患者体内自然突变株的存在情况。方法：收集门诊及住院患者共计104例,均为未经任何核苷(酸)类似物治疗的慢性乙型肝炎患者(CHB)和乙型肝炎肝硬化(LC-B)等慢性HBV感染患者,其中42例采用焦磷酸测序法检测耐药突变,62人采用PCR产物直接测序法检测耐药突变。结果：在焦磷酸测序组42例患者中,共检出3例(7.14%)自然耐药突变株,其中2例为原发性耐药突变(均为rtA181T)、1例为补偿性耐药突变(rtV173L)。在PCR产物直接测序法组的62例患者中,共检出6例(9.68%)自然耐药突变株,1例为原发性耐药突变(rtM2.04I变)、5例为补偿性耐药突变(2例rtV207L、2例rtS213T、1例N238T)。经统计学分析,两种检测方法、性别、疾病状态、年龄、谷丙转氨酶水平、谷草转氨酶水平、血清HBV-DNA载量、HBeAg量均与HBV自然耐药突变的出现没有明显相关。结论：自然发生的HBV耐药突变株,包括原发性耐药突变株和补偿性耐药突变株,可以存在于慢性HBV感染患者体内。但是耐药突变株的出现频率较低。是否对慢性HBV感染患者在核苷(酸)类似物治疗前进行耐药突变株的检测,还需要进一步研究。