【摘 要】
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基因组DNA序列上起始密码子邻近序列中,存在着一些功能保守区,我们在以前的工作中研究了酵母等几个模式生物基因组中起始密码子与L-Ter(从起始密码子上游同相位遇到的第一个
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基因组DNA序列上起始密码子邻近序列中,存在着一些功能保守区,我们在以前的工作中研究了酵母等几个模式生物基因组中起始密码子与L-Ter(从起始密码子上游同相位遇到的第一个终止密码)之间的平均距离及其距离分布,发现了一些有意义的结果.为了更深入的研究这一问题的普遍性,该文在第一部分中,选用了二十一种细菌,并把它们的全基因组中所有的ORF序列分成已知基因和不确定的ORF两大类,再按照不同的起始密码子(ATG、GTG、TTG)对每一类分别分成三种序列;分析计算了每种情况下起始密码子上游L-Ter到该起始密码子的距离分布和L-Ter(TAA、TAG、TGA)的相对使用频率.第二部分中,分析了大肠杆菌基因mRNA在转译过程中读码错位时,终止密码子的密度分布与蛋白质合成终止的关系,发现错位时在编码序列的尾段比首段出现较多的终止密码子,而首尾两段都比中间区段的密度大,说明错位时在编码序列的头和尾部的保守区域都有较强的使蛋白质合成终止的信号.第三部分中,研究了多肽链的氨基酸残基间氢键的分布,分析比较了二十种残基的NH和CO基团提供氢键的能力,发现氨基酸残基(除Ser外)的CO基团形成氢键的能力越强,其NH基团形成氢键的能力就越弱,反之亦然.
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