随着中国的经济发展步入新常态,经济的增速已经由高速逐渐变为中高速,中国的经济也越来越急需找到新的转型和发展增长动力,因此,改变传统的粗放型经济增长的方式,转而注重依靠自主创新能力和生产效率的实质性提升,已经逐渐成为推动中国经济持续健康发展的必要选择和途径。高技术产业作为知识密集型和技术密集型的产业,汇聚着大量的高端技术人才和先进的技术,是国家自主创新的基地和摇篮,也是科技成果转换的一个重要依托。而长江经济带作为我国重要的战略经济带和知识技术储备丰富的地带,沿线十一个重要省市之中遍布着许多国家级、省市级高技术产业基地和园区,被誉为是我国的“高科技走廊”。由此,长江经济带必将成为我国加速高技术产业的转型和升级的“主战场”,研究和评价长江经济带高技术产业的技术创新效率,对于长江经济带乃至我国产业结构的加速转型和升级、经济高效高质的持续发展,自主创新能力的提升以及创新性的国家发展战略的制定和实现,具有重要的意义。本文对长江经济带的高技术产业技术创新投入和产出现状进行了分析,并归纳和总结了长江经济带高技术产业在创新发展中存在的问题。然后运用随机前沿的分析方法对长江经济带2009-2016年的高技术产业技术研发和转化阶段创新效率以及影响因素进行评价与分析,明确高技术产业技术研发与转化阶段技术创新的效率及其损失来源。进而,从各地区和上中下游两方面对长江经济带高技术产业的技术创新效率进行区域差异分析,并且为了更加动态、全面地反映长江经济带高技术产业技术创新效率的变化轨迹和趋势特征,对长江经济带高技术产业的技术创新效率水平进行了收敛性的检验。最后,提出提升长江经济带高技术产业的技术创新效率的具体对策和改进措施。经研究发现:第一,长江经济带2009-2016年高技术产业技术研发阶段效率值大于技术转化阶段效率值。第二,技术研发阶段所有制因素和市场结构因素对高技术产业创新效率分别产生负向和正向影响;技术转化阶段政府支持力度、所有制因素与市场结构对高技术产业创新效率具有负向影响,而企业规模具有正向影响。第三,长江经济带11省市之间的技术研发效率和技术转化效率存在较大的差异,长江经济带下游地区高技术产业平均效率值最高,中游其次,上游最低。第四,长江经济带11省市间的创新效率差异呈逐渐收敛的状态,区域间的差异逐渐缩小。第五,长江经济带应进一步提高科研投入的使用效益、提高高技术产业聚集程度、加强区域间产学研合作、完善政府投入补贴机制和构建高技术产业协同创新发展体系,来提高整体区域的高技术产业技术创新效率。