人类TBC1D8B基因两个转录本的功能研究

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TBC结构域蛋白家族是含有一段由保守的氨基酸构成的TBC结构域的GAP蛋白(TBC/RABGAPs),可以特异识别并调节Rab活化状态,该家族蛋白的生物学功能与细胞膜紧密相关。因此,TBC/RABGAPs在调节细胞信号传导和细胞内其他的活动方面发挥重要作用,特别是调控肿瘤发生发展方面起着重要作用。可选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation, APA)普遍存在于真核生物中。由于APA位点的存在,基因可以通过不同的剪切引起编码区和3’UTR的改变,从而产生不同的转录产物。因此,APA也可以认为是新基因产生的一种机制。通过前期的比较基因组学分析,我们发现在人类TBC1D8B基因可以通过APA机制产生两种转录本(TBC1D8B-a和-b转录本),TBC1D8B-a在哺乳动物中广泛存在,TBC1D8B-b是人特异的。但是TBC1D8B的两个转录本的生物学功能尚不清楚。首先,我们筛选出适用于qPCR分析中最适内参基因ACTB,应用于后续的基因相对表达量研究;接下来,我们对TBC1D8B-a和-b转录本的功能开展系统地研究,结果显示:(1)由插入序列产生的TBC1D8B-b的3’UTR的序列无论是在不同人群,还是在不同的疾病组中,这段序列无任何突变位点,是高度保守的,提示可能具有重要的生物学功能;(2)实验验证了TBC1D8B-b以及编码的蛋白Tbc1d8b-b是人类特有的;(3) TBC1D8B基因的两个转录本在人类大多数正常组织或细胞中均有表达,而且TBC1D8B-a基因在前列腺癌、结直肠癌、肺癌中的表达显著高于正常组织;(4) TBC1D8B-a显著促进细胞增殖和DNA合成,加速细胞周期进程,提高细胞迁移和浸润能力,具有原癌基因的特征;当TBC1D8B-a活性中心位点突变(Arg538Lys和Gln573Leu)后,上述的功能全部丧失,表明TBC1D8B-a基因的功能依赖于其TBC domain的活性;(5)野生型TBC1D8B-b对细胞增殖、细胞周期进程和细胞迁移无明显影响,但是,当TBC domain的活性位点突变(Arg538Lys和Gln573Leu)后,会显著促进细胞增殖、细胞周期进程和细胞迁移;(6)利用高通量测序技术,我们分析了过表达TBC1D8B-a-wt, TBC1D8B-a-mt, TBC1D8B-b-wt和TBC1D8B-b-mt细胞株的转录组,预测了野生型TBC1D8B-a和突变型TB1C1DB-b可能的信号通路,发现两个转录本可能参与不同的信号通路。本研究是首次对TBC1D8B基因两个转录本开展的功能研究,不仅丰富了我们对TBC结构域蛋白家族的认识,而且增加了对人特异基因的起源及功能的认识,可能为癌症或疾病的诊断和治疗提供新的靶点,进一步可能为癌症或疾病的预防提供新的思路。
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