保税供应链金融的发展从一定程度上解决了保税港区内供应链各个主体融资难的问题，但随着各个主体的快速发展，要求保税供应链金融的发展做出相应的改革，而保税供应链金融协同运营从一定程度上可以解决各个参与主体快速发展中对于资金快速运作、信息共享以及技术共享的需求。本文在对相关文献和研究进行评述的基础上，围绕保税供应链金融协同运营这一问题，对保税供应链金融协同运营机理进行了分析，提出了保税供应链金融协同运营的序参量，构建了保税供应链金融协同运营机制，并结合重庆保税港现状，构建了重庆保税港供应链金融协同运营机制，其主要研究内容和结论如下：首先，通过对保税港区、供应链金融主体行为以及协同学基础理论进行阐述，界定了保税供应链金融的内涵和特点。其次，从保税供应链金融协同运营的角度，阐述了保税供应链金融协同运营的动力机制——竞争与协作。对协同学所研究的问题特点进行了阐述，分析了保税供应链金融协同运营系统的特点，进而过渡到使用协同学的序参量原理研究保税供应链金融协同运营机制。基于协同学角度，提出了保税港供应链金融协同运营机理的变量体系——外生变量和内生变量，从中选取了序参量，即资金运作效率、技术共享及信息共享，并阐述了保税供应链金融协同运营的自组织演化过程。然后，对保税供应链金融协同运营的主体及要素进行了分析，并根据保税供应链金融协同运营基本原则，设计了保税供应链金融协同运营机制，即资金运作效率机制、技术共享机制和信息共享机制。最后，结合重庆保税港供应链金融发展现状，设计了重庆保税港供应链金融协同运营机制。