目的:本文采用荧光差异显示凝胶电泳(DIGE)蛋白质组学方法及质谱技术筛选并鉴定胃癌组织差异表达蛋白质,以期寻找胃癌特异的肿瘤标记物,用于临床胃癌筛查和诊断,并为寻找胃癌治疗药物靶点、了解胃癌发生发展的分子机制提供思路。方法:采用DIGE技术筛选Cy3、Cy5及Cy2荧光素标记的胃癌及对应癌旁组织差异表达蛋白质,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)或串联质谱技术进行鉴定并分析,对可能有价值的差异表达蛋白质采用组织芯片免疫组化技术、反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术分别从蛋白质水平及信使核糖核酸(mRNA)水平进行验证。结果:共筛选出33个差异表达蛋白质点,其中9个蛋白质点在胃癌组织中上调,24个蛋白质点下调,对22个蛋白质点采用质谱技术成功鉴定。根据蛋白质功能的不同,这些差异表达的蛋白质可以分为7类:分子伴侣、细胞骨架蛋白、代谢酶类、细胞周期相关蛋白、细胞增殖、分化和凋亡相关蛋白和脂质代谢相关蛋白。锰超氧化物歧化酶、热休克蛋白60、突变节蛋白等在胃癌中高表达;热休克蛋白27、前列腺素F合酶、硒结合蛋白1、锌指蛋白160、微管蛋白α6、真核生物翻译延伸因子1,α1(eTEF 1 A 1)等在胃癌组织中低表达。结论:DIGE技术是筛选胃癌组织差异表达蛋白质有效方法。锰超氧化物歧化酶、突变结蛋白、HSP 60、HSP 27、前列腺合酶F、eTEF 1 A 1等可望成为胃癌诊断的特异标记物。对若干差异蛋白的编码基因的转录水平进行的分析发现,基因转录和翻译水平存在弱相关性。