本文针对循环经济建设中，以农业废弃物综合利用为主导形成产业共生的涉农企业发展模式，选择重点农业龙头企业九发集团产业园区为研究案例，定量评估产业生态系统的资源环境影响和生态经济效益，基于评估指标进行产业生态系统的重构与优化，为农业废弃物产业化增值模式以及农村新型工业化建设提供实证参考。 (1)围绕“食用菌一复合肥”链条形成的产业共生体系，有着完整的能量系统、物质综合利用系统和水系统，一定程度上具备与自然生态系统类似的组织结构和自我生产、自我消解的功能。产业共生体系的上下游食物关系形成产业链网，内部物质交换和循环利用比例高；为维护系统的整体利益，个别成员经济亏损，但系统整体上处于积累盈利状态；产业生态系统具备一定的环保性能和较好的社会功能。 (2)现有国民经济核算体系中没有计量自然资源耗减、环境质量降级等价值损失，借鉴SEEA框架，初步估算九发产业生态系统的绿色产值，结果表明经自然资源耗减和环境污染调整的系统产值下降较大，扣减指数为15.490％，在一定程度上反映了产业生态系统的真实发展结果，对促进可持续发展意义重大；生态效率已成为工业生态学的一个重要研究领域与组成部分，提高生态效率是发展循环经济的本质要求，测算结果显示，九发产业生态系统关键的原材料消耗产出率低于全国平均水平16％，废水排放产出率低于全国平均水平24％，能源消耗产出率与全国平均水平相当，说明系统虽然目前结构上比较合理严谨，但其功能还有待加强。 (3)能值理论构建了联通自然环境系统与经济社会系统的桥梁，针对九发热电分公司效益低的并网设计，能值分析表明，在现有工艺和市场价格不变的情况下，并入区域电网和热网，可以弥补电能需求不足的现状，发挥热电联产环境与经济优势；复合生态经济系统的能值分析中，自然子系统的能值自给率指标值低，系统运行受外部环境控制强；经济子系统中劳务能值几乎占到系统综能值用量的一半，是系统运行的最大驱动力；社会子系统的人均有效能值产出量指标值较好，表明系统中人均福利良好；系统的能值可持续发展指数仅为0．097，说明九发产业园区为消费型经济系统，系统的可持续发展能力亟待提高。 (4)生态经济综合指标既是产业生态系统诊断的依据，也是产业生态系统优化方案的评判。改煤基发电为秸秆混烧发电，同时并入区域电网，可以有效改善九发热电分公司的资源环境效益，代表着新型工业化道路；为避免化肥的使用，撤掉复合肥分公司，建立蚯蚓生物肥厂并结合双孢菇分公司、真姬菇示范同和果蔬汁分公司规模适度扩人，则可以现实不可再生资源的减量化，扩展农业废弃物变废为宝的范围，达到经济与环境的双赢；通过提高废水处理标准和输水管道建设，系统处理后废水可以用于农业补水和热电厂冷却用水。