高等教育经费的合理配置,是加强高校教育资源管理的客观要求,是关系教育发展战略的重要课题。对高校教育经费配置效率进行研究,并分析影响高校教育经费配置效率的影响因素,为优化高校教育经费配置效率的途径研究提供参考,促进高校加强对教育经费配置的调节分析,提高经费利用效率。本文在考虑高校产出的异质性与产出质量的基础上,建立了包含产出质量的高校教育经费的投入产出指标体系。同时,借鉴资本产出弹性思想,构建了高校教育经费配置效率评价模型,反映高校财力资源迁移的本质及经费配置的效果。在此基础上,运用SPSS回归分析内外部环境因素对配置效率的影响程度,找出高校教育经费配置效率的影响因素。结果发现：(1)我国教育部直属高校教育经费配置情况并不可观,教学经费投入存在冗余,而部分类型高校如理工类、农林类高校存在科研经费投入不足的情况；(2)在配置效率的内部因素中,高校规模、融资多元化程度均显著影响高校教育经费配置效率,高校规模的过度扩张会导致教育经费配置效率的降低,而高校融资多元化则会提升科研经费配置效率,但负债经营会降低教学配置效率；(3)在配置效率的外部因素中,高校所在地区的经济水平、政策支持程度因素均显著影响高校教育经费配置效率。高校所在城市经济发展水平高,则高校教育经费配置效率越高；国家政策支持程度越高,高校教育经费配置效率也越高。本文的主要创新点在于：一是构建了包含高校产出的质量特征的高校教育经费配置效率评价指标体系；二是借鉴了资本市场的配置效率方法,基于资本产出弹性思想,构建了高校教育经费配置效率评价模型。本文的选题来源于冯宝军教授主持的国家自然科学基金“基于成本构成分析的研究型大学教育成本管理效率评价研究(71240005)”。