近年来,高校教育体制改革为高校发展创造了良好的机遇,我国高等教育得到迅速发展,各高校办学规模也随之急剧扩大。《教育法》所确立的新的办学体制赋予了高校一定程度的办学自主权,标志着高等教育经费来源由国家财政拨款、专项财政拨款、学费收入和其他创收相结合的多元化的办学经费筹措体制从此确立。高等学校收入的多元化,在一定程度上减轻了国家负担,但也使得高校财务工作越来越复杂,管理的难度也越来越大。因此,加强对高校二级财务管理具有重要的理论与实践意义。目前,各高校全校性的财务规章制度都比较健全和完善,但在逐步下放财权给各二级院、系时,与其承担责任相对应的二级财务管理规章制度、内部控制制度却未完全形成,导致对各二级院、系收入支出控制无力,缺乏对其实施有效的动态监控。有些高校虽然采取了一定的措施,在一定程度上加强了高校对二级院、系的财务监督,但是仍然存在很多理论和实践方面的问题。本文在对国内外研究现状分析、研究的基础上,首先指出了我国高校二级财务管理中存在的问题,分析了其产生的根源,其次提出了加强高校二级财务管理的改进措施。本文指出提高高校二级财务管理水平,要引入管理会计的方法和体系,根据高校财务绩效评价指标体系建立的原则,构建能全面反映当前高校特点的财务绩效评价指标体系。本文以南方某高校为例,采用规范性研究,定量分析与定性分析相结合、理论分析与调查研究相结合,联系二级财务管理的现状,就如何构建一套适合高校二级财务管理的模式及绩效评价体系进行了深入的研究。