结核分枝杆菌GntR/FadR家族转录调控因子Rv0494蛋白的功能研究

来源 :西南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:killall2009
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, MTB)是结核病的病原菌。众所周知,结核病是一种慢性呼吸道的传染病,肺部通常最易受侵袭,大约占10%发展为活动性肺结核。结核分枝杆菌是目前致死率最高的致病菌之一[1]。研究表明:每年有上百万的人感染结核病,已经成为死亡率仅次于艾滋病的第二大传染病。尽管最近几十年已经有很多研究致力于研发新药物来治疗结核病,但是由于多重耐药、广泛耐药性结核分枝杆菌的出现,结核分枝杆菌生物膜的形成以及与HIV的共感染[2,3],给人类治疗结核病带来极大的挑战。结核分枝杆菌在面对各种压力环境下,主要通过进化出一系列的修复机制、耐受机制以及自身内部的调控机制来维持其生存和繁殖。其中,结核分枝杆菌自身内部的转录调控机制对其在各种压力环境下的生存、致病性至关重要。目前,有研究表明:结核分枝杆菌的基因组中包含大量的潜在具有转录功能的基因,如GntR家族,因该家族成员和葡萄糖酸盐调控因子具有相似性,故被称为GntR[4]。 GntR家族许多成员已经被证明对结核分枝杆菌在各种压力环境下的存活发挥着重要的作用。该家族的一个显著特点是N末端具有保守的DNA结合区域,主要是发挥转录调控功能的结合区域,但是其C末端域不具有保守性,主要是因为C末端包含不同的效应器结合域或者低聚物[5]。鉴于C末端域的异质性,我们将GntR家族成员分类为不同的亚家族。目前,GntR家族成员可分为4个亚家族,分别是:FadR, HutC, MocR, YtrA亚家族[6,7],Rv0494蛋白则属于FadR亚家族。这些调控因子在细胞生理中发挥重要的功能,多数转录因子参与调控各种代谢途径的基因,例如氧化压力环境下所涉及到的氨基酸代谢或者其他代谢途径[8]。GntR家族转录因子通常发挥双重调控功能,即同时具有转录激活和转录抑制的作用。在某些细菌中或者在某种特定条件下,GntR家族成员具有激活特定基因转录的功能,同时也能激活或阻遏其他基因转录。有趣的是,许多转录调控因子还具有自调控功能,能够调控自身基因的转录[9]。研究表明,结核分枝杆菌H37Rv基因组中有7个基因包括:Rv0043c,Rv0165c, Rv0494, Rv0586, Rv0792c, Rv1152和Rv3060c编码GntR蛋白,其中Rv0043c, Rv0165c,Rv0494, Rv0586和Rv3060c(Ⅰ和Ⅱ)编码的相应蛋白属于FadR亚家族成员,FadR亚家族在GntR家族中最具有代表性[4]。因此,本文选择FadR亚家族的Rv0494蛋白进行研究其相关的转录调控功能。目前,结核分枝杆菌GntR家族成员在分枝杆菌中是如何发挥相关转录调控功能尚不明确。耻垢分枝杆菌是一种快生型的非致病性分枝杆菌,是被广泛应用于研究致病性结核分枝杆菌的模式细菌。本文为研究GntR家族转录因子在分枝杆菌中的相关功能,从结核分枝杆菌基因组克隆Rv0494基因,分别进行酶切连接构建pET28-Rv0494和pNIT-Rv0494重组质粒,从而通过构建过表达菌株M. s-pNIT(myc)-Rv0494,采用电泳迁移率检测(Electrophoretic mobility shift assay, EMSA),启动子活性测定等实验方法,证实Rv0494蛋白能与自身启动子结合,这部分主要研究了该蛋白的自调控功能。第二部分实验进一步研究Rv0494过表达是否对耻垢分枝杆菌的菌落形态、生物膜形成、滑动能力以及对一线抗结核药物的耐受等产生影响,同时应用十二烷基硫酸钠(Sodium dodecyl sulfate,全文简写为SDS)、过氧化氢(H2O2)、饥饿环境(PBS)、氧化剂联氨等模拟各种压力环境,鉴定Rv0494蛋白是否参与胁迫应答,同时通过测定生长曲线检测Rv0494对过表达菌株M.s-pNIT(myc)-Rv0494生长速率的影响。通过以上实验结果显示Rv0494蛋白能特异性与自身启动子结合属于自调控转录因子,通过加入β-疏基乙醇处理证实Rv0494蛋白在体外是以单体形式存在。另外,实验进一步空载和实验组重组耻垢分枝杆菌单菌落形态、滑动能力和生物膜形成、对抗生素的耐受以及脂肪酸的种类均无明显差异。因此,初步证实Rv0494蛋白对耻垢分枝杆菌的表型无明显影响。同时,通过测定生长曲线发现Rv0494重组蛋白对宿主菌的生长速率无明显影响。但是,我们采用滴板和双层琼脂法比较对照菌和重组菌在H2O2和SDS以及氧化剂联氨压力下的存活差异。结果证实,当H2O2浓度在1%,SDS终浓度为5%时,重组菌的抑菌圈明显小于空载菌,具有统计学差异。当联氨浓度为5mM时重组菌完全不生长,而空载菌能够生长。这可能是因为该蛋白下调了重组菌的生理活性相关基因,从而减缓了宿主菌的生长。总的来时,该蛋白在分枝杆菌代谢以及应激条件下的存活发挥重要的作用。并且对各种压力环境条件下产生应答,发挥其转录调控功能。
其他文献
霞草为石竹科石头花属植物霞草GypsophilaoldhamianaMiq.的根。该品全国分布较广,主产于山东、山西、陕西、宁夏、内蒙古、甘肃、新疆、河北、黑龙江等地。该植物为我国民间常
目的:采用定量系统评价方法比较兰索拉唑与临床上常用的其它质子泵抑制剂(PPI)治疗胃食管反流病(GERD)的临床疗效与安全性,为PPI制剂的有效安全合理应用提供循证支持。方法:计
芍芪多苷( Shaoqiduogan , SQDG )是将药材白芍和黄芪按照最佳剂量配比,运用现代提取分离技术制成的有效部位。本所以往研究证实,SQDG对大鼠免疫性及化学性肝损伤均具有保护作用,且发现对一些细胞因子有调节作用,为了系统探讨SQDG对免疫的影响,本实验就SQDG对小鼠细胞免疫的作用进行了研究,并探讨了其部分作用机制。目的:探讨在不同免疫状态下,SQDG对迟发型变态反应(delayed
本文通过对荣华二采区10
期刊