随着企业面临的经营环境越来越复杂,企业的经营风险越加不可控,内部控制本身的优势受到越来越多的企业管理者重视,我国为了大力推广企业内部控制,加强内部控制体系的建设,出台了《企业内部控制基本规范》及其配套指引,建立了我国的内部控制规范体系。但是,越来越多的企业建立完善的内部控制体系,在实施过程中却没能有效“落地”,内部控制体系在企业中仅仅成为了一堆文件或应付政策的手段,因此,如何让内部控制在企业中得到有效实施成为人们关注的焦点。信息技术的发展推进了企业各方面信息系统的普及,通过信息系统进行经营管理有效的提高了企业的市场竞争力。而同时信息系统的使用对企业的内部控制也产生了深远的影响,为企业内部控制的“落地”提供了有效渠道,通过整合内部控制与信息系统,内部控制能够以新的方式在企业运行,将内部控制文件变为信息系统中的刚性控制,使人工控制下的内部控制通过信息系统成为实时控制、自动控制,提高内部控制的有效实施,充分发挥内部控制的作用,提高企业的管理及效率,促进企业战略目标的实现。本文基于以上背景,在梳理内部控制以及信息系统相关理论的基础上,结合我国内部控制与信息系统建设的现状,给出了整合内部控制与信息系统的内涵、必要性、特征、优势、目标以及对策,同时对S公司的内部控制与信息系统整合进行研究,分析S公司的内部需求,结合S公司的信息系统现状,对S公司的内部控制与信息系统进行整合,并评价整合效果。通过研究,得出整合企业内部控制与信息系统有助于企业内部控制有效实施的结论,同时总结了内部控制与信息系统整合需要注意的方面以及整合的局限性,为研究内部控制的有效实施提供了帮助,也为后人的研究开拓了空间。