实时荧光PCR检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的研究

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目的建立快速、准确检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的实时荧光PCR方法,为临床诊断提供新的实验室依据。方法运用实时荧光PCR,以3组细菌,即耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌,表皮葡萄球菌的DNA为模板,以nuc基因和mecA基因为靶序列进行扩增,建立运用实时荧光PCR检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的方法;再确定运用细菌基因组DNA抽提试剂盒直接从全血中提取细菌DNA的灵敏度;最后从临床或疑似诊断败血症病例中抽取血标本,用细菌基因组DNA抽提试剂盒直接提取细菌DNA,进行实时荧光PCR扩增,结果与常规的细菌检测方法做比较,分析其灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值。结果1.实时荧光PCR示,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌组各菌株nuc,mecA均阳性;甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌组各菌株nuc均阳性,mecA均阴性;表皮葡萄球菌组各菌株nuc,mecA均阴性。2.血标本中提取耐甲氧西林金黄色葡萄球菌DNA的结果示10-2及其以下稀释度的全血标本都无法用细菌基因组DNA抽提试剂盒提取细菌DNA,而5次平板菌落计数结果分别为3.83×109CFU/ml,4.10×109 CFU/ml,8.37×109 CFU/ml,3.65×109 CFU/ml,5.36×109 CFU/ml,均为109 CFU/ml。即只有当血液中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌在107CFU/ml及其以上时才能被试剂盒提取细菌DNA。3.临床验证部分,通过对抽取的135例血标本进行实时荧光PCR检测,结果显示nuc阳性的共10份,mecA阳性的共6份。135份血标本血培养阳性的有46份,其中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌阳性13份,甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌阳性9份,表皮葡萄球菌阳性10份,其余细菌阳性13份。将血培养耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌,表皮葡萄球菌阳性的血标本组成4个组,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌为第一组,甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌为第二组,做对照以评价实时荧光PCR扩增mecA基因快速检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的效应,结果示灵敏度为46.15%(6/13),特异度为100%(9/9),阳性预测值为100%(6/6),阴性预测值为56.25(9/16)%;以金黄色葡萄球菌(耐甲氧西林金黄色葡萄球菌+甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌)为第三组,表皮葡萄球菌为第四组,做对照以评价实时荧光PCR扩增nuc基因快速检测金黄色葡萄球菌的效应,结果示灵敏度为45.45(10/22)%,特异度为100%(10/10),阳性预测值为100%(10/10),阴性预测值为45.45%(10/22)。结论实时荧光PCR可以快速,准确地检测血标本中的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,但灵敏度有待提高。
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