汶上芦花鸡蛋品质及其候选基因遗传效应分析

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为了摸清汶上芦花鸡的蛋品质特点,探究候选基因对蛋品质性状作用大小,本研究以384只汶上芦花鸡为研究对象,首先测定了30周龄,40周龄和50周龄时所产鸡蛋的蛋重、蛋形指数、蛋壳厚度、蛋壳强度、蛋白高度、蛋黄颜色、哈氏单位、蛋黄重、蛋壳重、蛋白重、蛋黄比例、蛋壳比例、蛋白比例共13个蛋品质指标,然后比较了不同周龄蛋品质的差异,计算了不同蛋品质性状间的相关系数;最后,通过质谱分型方法对14个蛋品质候选基因的22个SNPs进行基因分型,并与蛋品质性状进行关联分析。研究结果如下:(1)本研究通过比较汶上芦花鸡不同周龄蛋品质发现,蛋重、蛋黄重、蛋壳重、蛋白重、蛋黄比例随着周龄增加而显著增加(P<0.05),蛋壳厚度、蛋白比例随着周龄增加而显著减少(P<0.05);30,40周龄的哈氏单位和蛋壳比例显著高于50周龄(P<0.05);30周龄蛋壳强度与蛋黄颜色显著高于40周龄和50周龄(P<0.05);40周龄和50周龄蛋形指数显著高于30周龄(P<0.05);30周龄和50周龄蛋白高度显著高于40周龄(P<0.05)。(2)各周龄不同性状间相关性比较一致。30、40、50周龄蛋重与蛋黄重、蛋壳重、蛋白重和蛋黄比例均呈正相关;30、40、50周龄蛋壳厚度与蛋壳强度、蛋壳重和蛋壳比例均呈正相关;30、40、50周龄蛋白重与蛋黄比例、蛋壳比例呈负相关,与蛋白比例呈正相关;30、40、50周龄蛋黄比例、蛋壳比例与蛋白比例呈负相关。(3)在14个基因的22个SNPs中,有19个SNPs为汶上芦花鸡群体中新发现的多态位点。关联分析结果发现,对于30、40、50周龄,OCX基因的G6612A位点GG型蛋壳厚度显著高于AA型,ENOX1基因的rs13968880位点CC型蛋白高度显著高于TT型;对于30,40周龄,OCX基因的T6101C位点TT,TC型蛋白重显著高于TT型,TT型蛋形指数显著高于CC型,ENOX1基因的rs13968880位点TT型蛋黄重,蛋黄比例显著高于TC型和CC型;对于30、50周龄,OCX基因的G6612A位点GG,GA型蛋壳厚度显著高于AA型,G7158A位点GA型蛋壳厚度显著高于AA型,AA型蛋白高度和哈氏单位显著高于GG型,FSHβ基因的C642A位点CA型蛋白重显著大于CC型。(4)对蛋品质性状有显著影响的SNPs计算其对表型方差的贡献率(CPV),结果显示OCX32基因的T6101C与30周蛋白高度、哈氏单位、蛋白重、蛋黄比例、蛋白比例,40周蛋重和蛋白重,50周蛋白高度和哈氏单位有显著相关(P<0.05),对其表型方差的贡献率为3.84%-7.09%;OCX32基因的G6612A与30周蛋壳比例、蛋壳厚度、蛋白高度、蛋白比例,50周蛋壳厚度和蛋白高度显著相关(P<0.05),对其表型方差的贡献率为3.25%-5.35%;OCX32基因的G7158A与30周的蛋壳厚度、蛋壳比例、蛋白比例,50周蛋壳厚度和蛋白高度显著相关(P<0.05),对其表型方差的贡献率为2.87%-7.45%;CA7基因的rs314570368与30周龄的蛋壳厚度和哈氏单位有显著相关,对其表型方差的贡献率分别为11.05%和10.52%,rs14964613与40周龄蛋形指数显著相关(P<0.05),对其表型方差的贡献率为7.92%;FSHβ的C642A与30周龄蛋重和蛋白重显著相关(P<0.05),对其表型方差的贡献率分别为10.08%和10.40%。CDH13基因的rs14966715与30周龄蛋重、蛋形指数、蛋黄重显著相关(P<0.05),对其表型方差的贡献率为4.95%-6.23%;ENOX1基因的rs316056011与30周蛋形指数和蛋黄重,40周的蛋白比例显著相关(P<0.05),对其表型方差的贡献率为2.42%-4.20%,rs13968880与30周蛋黄重、蛋黄比例、蛋白比例,40周蛋黄重、蛋黄比例、蛋白比例,50周蛋白高度显著相关(P<0.05),对其表型方差的贡献率为3.78%-9.30%;ZNF536基因的与30周龄蛋白重显著相关,对其表型方差的贡献率为3.77%;OIH基因的A138G与40周蛋形指数显著相关(P<0.05),对其表型方差的贡献率为2.88%;NCAPG基因的C6461T与50周龄蛋重,蛋白重显著相关(P<0.05),对其表型方差的贡献率分别为9.65%和9.36%。综上所述,汶上芦花鸡蛋品质性状随着周龄增加而显著变化;30、40、50三个周龄蛋壳厚度与蛋壳强度、蛋壳重、蛋壳比例呈正相关;OCX32基因、CA7基因、FSHβ基因、CDH13基因、ENOX1基因、ZNF基因、OIH基因、NCAPG基因的SNPs对汶上芦花鸡蛋品质有显著影响,有望成为蛋品质性状分子标记辅助选择的有价值标记。
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