WES筛查RP致病基因PRPF31新位点及RP候选基因EMC9的功能研究

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视网膜色素变性(retinitis pigmentosa,RP)是一种遗传性眼部疾病,它最终会导致失明。目前已鉴定了超过70个RP基因,但仍有35%45%的RP病人无法用已知基因解释,根据该疾病的相关研究提示还有很多未知RP基因等待鉴定。基于我们对RP复杂发病机制的认识不清晰,目前尚缺乏并且公认有效的干预手段来防治RP。对RP致病基因新突变及新型候选基因的发现是首要目的,对RP分子诊断、治疗方向和分子遗传学研究具有重要意义。然而传统Sanger测序已经无法满足需求,其费用高额、耗时巨大、且无法获取未知致病基因,随着二代测序技术的发展,全外显子测序(whole exome sequencing,WES)运用在疾病研究中成功案例越来越多,它们逐渐成为疾病研究中极为常用的筛查手段,它们具有高的灵敏度,低成本投入等优点,值得一提的是WES可以检测到未知致病基因。在此研究中,我们利用WES对收集到的家系及散发患者筛查,得到RP已知致病基因的一个新致病突变位点、一个候选致病突变位点和一个常染色体隐性遗传(arRP)候选基因:(1)在中国人群中,我们检测到常染色体显性遗传(adRP)基因PRPF31一个新型移码突变c.12261227insA(p.T410Dfs*65),与一个候选终止突变c.1015C>T(p.Q339*)。在1000例正常人中没有这些突变位点。(2)对前期筛选出的arRP候选基因EMC9及其突变位点c.59G>A(p.R20Q)的初步功能研究。EMC9在正常小鼠视网膜、睾丸、脊髓、小脑、大脑呈现高表达。我们成功构建了EMC9质粒pCDNA3.1-EMC9-FLAG-WT和pCDNA3.1-EMC9-FLAG-MUT(59G>A),与WT组相比较,pDNA3.1-EMC9-FLAG-MUT细胞蛋白表达量降低90%以上,且其蛋白定位呈缺失状态。这些均与基因突变的致病性一致。下一步我们打算构建EMC9基因敲除小鼠,EMC9基因对视网膜功能的影响有待进一步研究。综上所述:(1)我们通过WES,发现了中国人群RP患者中已知adRP基因PRPF31的新型突变,扩大了RP致病基因突变谱,给产前诊断提供新思路。(2)对新发现的RP基因EMC9及其新位点c.59G>A(p.R20Q)进行了初步的功能研究,其突变导致了蛋白不稳定表达,从而可能导致疾病。
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