在总结1997年亚洲金融危机和借鉴西方发达国家经验的基础上，国务院于1999年批准设立科技型中小企业技术创新基金（以下简称“创新基金”）专门用以资助科技型中小企业的创新活动。江西省于2000年率先设立了省级科技型中小企业技术创新基金（以下简称“江西省创新基金”），主要用于江西籍国家创新基金项目的匹配资金及为创新基金申报培育项目源；并成立了省级科技型中小企业技术创新基金管理中心（以下简称“江西省创新基金管理中心”），主要工作是对江西省创新基金进行专项管理。本文以江西省创新基金自设立以来（2000-2011年）12年间的运行数据为依据，以对江西省创新基金实施效果的评价为主要目的，重点分析了江西省创新基金运作过程中科技型中小企业的项目情况，投入、产出情况以及投入产出效率情况。创新项目是创新基金直接资助对象，对江西省创新基金实施效果的评价主要针对的是立项项目和立项项目之中的已验收项目。立项项目情况包括江西省各年的立项数量分布，各区市的立项数量分布，各技术领域的立项数量分布。已验收项目情况包括创新基金经费带动的社会的效应及项目验收时企业得到的成果。在投入、产出分析数据的基础上运用DEA方法计算了江西省创新基金投入产出效率。最后根据分析结果，总结了江西省创新基金存在的问题以及相应的对策建议。