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大菱鲆（Scophthalmus maximus）和牙鲆（Paralichthys olivaceus）是我国沿海和北方地区重要的海水养殖鱼类品种。近年来，随着海水养殖不断迅速发展，不仅带动了我国经济的发展，也增加了劳动就业机会，缓解了人口食物需求对陆地农业的压力，但随之更深层次问题陆续出现，发展的越来越严重，尤其病毒性疾病，给海水养殖的经济利益带来了严重的不利影响。干扰素（interferons,IFN）在抗病毒免疫过程中具有重要的作用，因此，对大菱鲆和牙鲆干扰素系统中的有关的基因的的深入研究具有不可估量的重大意义。该研究分别采用逆转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）、同源PCR克隆(Homology PCRCloning)和cDNA末端快速扩增(Rapid Amplification of cDNA ends, RACE)技术，从大菱鲆和牙鲆脾脏组织中分别获得STAT1（transcription factors signal transducers and activators oftranscription1）和IRF9（Interferon regulatory factors9）基因的全长cDNA序列。STAT1涉及Ⅰ和Ⅱ IFN信号通路，在实验研究中成功克隆的大菱鲆STAT1有3种不同的cDNA变异体（全长分别为3072bp，2970bp和2960bp），它们仅仅在3’非翻译区（untranslatedregion，UTR）不同。序列分析表明，cDNAs是由不同的加尾位点形成。STAT1cDNA所编码的750个氨基酸，与其他鱼类的STAT1s具有58.8-92.7%的一致性，并且拥有DBD（DNA binding domain）, SH2(SH2domain), TAD（transcriptional activation domain）区域。本文克隆的另一基因牙鲆IRF9，cDNA长3305bp,包括272bp5’-UTR,1725bp3’-UTR，编码435个氨基酸残基包含有DBD，IAD（IRF association domain），NLS（nuclearlocalization signal），PRD （proline-rich domain）等区域。牙鲆IRF9的序列同其他鱼类具有33.7-72.0%的一致性和61.9-80.5%的相似性。定量PCR分析大菱鲆STAT1和牙鲆IRF9在12种组织中即脑、鳃、胃、肠、心、头肾、体肾、肝、脾、性腺、肌肉和皮肤组织的表达。实验结果表明都呈组成型表达，大菱鲆STAT1在肠，头肾，肝脏，脾脏组织中表达量较高；牙鲆IRF9在头肾，肾，肝脏，脾脏组织中的表达量较高。此外，我们还利用定量PCR研究了大菱鲆STAT1受到poly I:C和TRBIV诱导后在0h,3h,6h,12h,1d,2d,3d,4d,5d,7d时间点，牙鲆IRF9分别在0h,3h,6h,12h,1d,2d,3d,4d,5d,7d时间点受到poly I:C和在0h,6h,12h,18h,1d,2d,3d,4d,5d,7d时间点受到LCDV诱导后的动力学表达模式。实验表明大菱鲆STAT1和牙鲆IRF9在受到外源刺激的7d早期阶段，poly I:C均是快速的诱导者。在分别受到2种外源刺激后，大菱鲆STAT1和牙鲆IRF9表达最强烈，最快的均是脾脏组织。就poly I:C诱导而言，大菱鲆STAT1在脾，肾脏，鳃，肌肉的最高表达量为2.7-,3.9-,4.2-和4.4倍。此外，鳃和脾脏组织分别在5d,3d时间点出现弱峰，表达量分别是2.8和3.5倍。而牙鲆IRF9除了在脾脏中有所表达，在其他组织中的表达微弱，脾，鳃，头肾，肌肉中的表达量分别是8.6-,1.4-,1.3-和2倍；这些结果表明STAT1和IRF9均参与到了宿主的抗病毒免疫反应中。就大菱鲆受TRBIV诱导而言，STAT1基因表达最高量在鳃，头肾，脾和肌肉中分别在2d,1d,3d,5d以表达量3.4倍，3.5倍，4.5倍和2倍出现；而头肾和脾脏中5d,3d出现第2波峰，表达量分别为2.9倍和4.5倍。就牙鲆受LCDV诱导而言，脾脏在3d达到最高表达量约3.2倍，而其他组织几乎没有上调表达，与对照组保持相同的水平。本实验研究的大菱鲆STAT1和牙鲆IRF9的全长cDNA得到成功克隆并分别对他们的表达水平变化情况进行了相应的分析，了解了大菱鲆STAT1和牙鲆IRF9基因的表达变化，为进一步研究鱼类干扰素系统的信号转导途径、获取有效的合理的经济的大菱鲆和牙鲆病毒性感染等工作提供了相关的理论知识。