药品专利保护是专利权人研发投入获得回馈的重要途径,但过高的保护标准又会对公共健康产生一定影响,如何平衡公共健康与专利权人的利益是药品专利法律制度与政策必须解决的矛盾。在专利法第四次修改过程中,援引药品专利链接制度的探讨较为热烈。一方面,当前国际社会部分国家仍然对我国药品专利保护水平有所不满,国内有学者主张通过这一制度进一步提高药品领域专利保护水平。另一方面,也有学者对该制度可能导致的过高的保护标准及与我国国情的不适应问题表示担忧。2017年以来,《关于鼓励药品医疗器械创新保护创新者权益的相关政策(征求意见稿)》、《关于深化审评审批制度改革鼓励药品医疗器械创新的意见》及《药品注册管理办法(修订稿)》等多份文件对该制度进行了初步设计。可以看出,这一制度在我国建构已经是较为明确的事,但从当前规定来看,该制度还处于初创阶段,较多规则都需要完善。因此本文从如下四部分对该制度的完善进行了研究。第一部分是药品专利链接制度的一般分析。首先对该制度的概念及历史发展进行了分析,厘清了该制度的发展脉络,并对该制度中涉及的相关概念进行了比较分析。其次分析了该制度的运新机制,论述了制度运行过程中涉及的相关主体与利益博弈,以及制度赖以运行的具体规则。最后从该制度的价值与在我国完善的现实必要性角度论述了该制度在我国实施的正当性。第二部分是我国药品专利链接制度的现状及问题分析。首先对我国现有法律法规中关于该制度建构的文件进行了分析,得出当前我国的初步制度框架。其次分析了我国现有制度设计亟待完善的问题,主要包括宏观层面缺乏法律政策统筹及不同主体之间的协同机制,具体规则中对专利权人保护和仿制药企业激励力度不足以及目录集专利信息公开规则与配套机制有待细化等问题。第三部分是药品专利链接制度国际实践的比较法考察。为了与本文研究更好关联,更好发挥对我国制度设计中存在问题的启示作用,从协同运行机制、专利权人保护和仿制药企业激励制度等方面对美国、加拿大、欧盟、日本以及TPP等关于该制度的措施进行了具体分析,总结出其对我国制度完善的启示。第四部分是我国药品专利链接制度的完善建议。结合我国具体问题和国外实践经验,从完善制度协调运行机制、提高专利权人保护水平、优化仿制药企激励制度及细化专利信息公开与专利诉讼规则四方面对我国药品专利链接制度的完善提出了针对性建议。