药品专利反向支付协议的达成,造成价格昂贵的专利药产品长期占领市场,增加消费者生活成本的同时,其推迟或阻止仿制药上市甚至可能造成排除或限制竞争的垄断效果,我国立法对其进行规制已迫在眉睫。该协议的规制涉及到竞争法和知识产权法法益冲突问题。《专利法》对于诉讼和解协议达成后法律关系的调解存在局限性,《反垄断法》对于该协议的规制具有必要性。在确定反垄断规制的原则和标准的过程中借鉴美国和欧盟的发展经验,结合药品专利反向支付协议在我国的发展现状,进一步完善我国的反垄断法体系。本文主要从反垄断法角度分析,自药品专利反向支付协议对于我国市场竞争造成的消极影响出发探索我国反垄断法规制药品专利反向支付协议的完善路径。第一,将药品专利反向支付协议纳入《滥用知识产权的反垄断法规制指南》中予以专门规制,改善目前我国缺乏相关法条对该协议规制的现状。第二,药品专利反向支付协议涉及到知识产权和垄断之间的微妙关系,要确定滥用知识产权的界限与规制方式。知识产权是否合理使用主要针对其使用范围而言,而滥用知识产权造成排除或限制竞争效果则更为注重其对市场竞争造成的影响。因而适用《反垄断法》对其予以规制则更为适宜。第三,由于反垄断法规制药品专利反向支付协议目前缺乏统一的分析模式,造成反垄断案件同案不同判现象,影响反垄断法规制该协议的预判性。通过与本身违法原则、合理原则、专利排他测试方法及快速审查原则的对比确定考量因素更为全面,对协议的定性、行为的特征、产生的效果进行综合比较的合理原则作为统一的分析模式。第四,在确定统一分析模式的基础上,确定适用合理原则考量因素的范围应当包括分析行为的特征和表现形式、制药企业在相关市场的市场支配力及其对效率和创新的影响等。第五,明确适用豁免条件的前提为垄断协议性质的认定,从而理顺《反垄断法》13条与15条之间的逻辑关系。2020年1月份出台的《反垄断法修订草案(公开征求意见稿)》中将鼓励创新作为立法目的之一,与专利权利益保护的观点不谋而合。