菊头蝠科(Rhinolophidae)和蹄蝠科(Hipposoderidae)同属小蝙蝠亚目,菊头蝠超科,且均为旧大陆蝙蝠种类.该研究首次运用PCR直接测序法,获得分布于中国的11种菊头蝠和蹄蝠以及日本的2种菊头蝠(含1亚种)的细胞色素b基因部分片段(528bp).结合以前的研究报道,该文从分子角度对菊头蝠科和蹄蝠科科间、科内的系统进化关系,以及菊头蝠科内角菊头蝠两个亚种的分类地位作了研究.该文首次对15种(含2亚种)菊头蝠和蹄蝠以及外群(2种狐蝠)的cyt b序列进行分析.分析结果表明:(1)角菊头蝠(Rhinolophus cornutus)和角菊头蝠一亚种(R.c.perditus)之间的遗传距离为1.34%,角菊头蝠和其另一亚种(R.c.pumilus)之间的遗传距离为1.93%.(2)在研究蹄蝠的进化地位时,遗传距离分析发现:菊头蝠和蹄蝠间平均遗传距离是16.67%,高于菊头蝠内的平均遗传距离9.26%和蹄蝠间平均遗传距离13.56%.普通长翼蝠属蝙蝠科,长翼蝠属,是一种广布性蝙蝠.该文同时也采用细胞色素b基因全序列(1140bp)对普通长翼蝠分布在中国、日本、澳洲和西班牙的种群间的系统进化关系进行研究.结构表明所有的亚太地区种群形成一个单系群.在这个单系群中,中国、日本、澳洲三地区的普通长翼蝠之间有密切的亲缘关系:中国和日本的亲缘关系最近,其次是澳洲和日本的亲缘关系,澳洲和中国的亲缘关系最远.该文同时结合地理事件,从分歧年代推测中日澳三地种群间可能的进化途径:中、日普通长翼蝠大约在2.5-3.2百万年前的这段时间分离,正好也对应于第四纪冰川期,推测可能在冰川形成期间海平面波动,冰川世纪早期,海平面下降,暴露出一条陆桥连接中国和日本,这时日本和中国大陆架相连,两地蝙蝠有交流;随后在冰川间期,中日两陆地被海水隔开以及以后的数次冷暖变化造成现在的进化格局.该文的研究同时也证实了在研究象普通长翼蝠这样分布地特殊,分离时间很久的种群间进化关系时,线粒体细胞色素b比较适合作其分子标记.