【摘 要】
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植物杂种优势的研究始于一百多年前,然而时至今日,杂种优势的遗传机制仍不明确,因此,选择两个优良品种的甘蓝F_1代及其双亲,调查统计9个与叶球相关的园艺学性状,计算中亲优势和超亲优势,同时,取各甘蓝部分结球叶片进行转录组测序分析,比对不同组合的双亲与杂种之间的差异表达基因(DEGs),探讨差异表达基因富集的主要生物学功能和代谢通路,此外,对杂种中基因表达模式进行划分并分析调控杂种内基因表达的顺式和反
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植物杂种优势的研究始于一百多年前,然而时至今日,杂种优势的遗传机制仍不明确,因此,选择两个优良品种的甘蓝F1代及其双亲,调查统计9个与叶球相关的园艺学性状,计算中亲优势和超亲优势,同时,取各甘蓝部分结球叶片进行转录组测序分析,比对不同组合的双亲与杂种之间的差异表达基因(DEGs),探讨差异表达基因富集的主要生物学功能和代谢通路,此外,对杂种中基因表达模式进行划分并分析调控杂种内基因表达的顺式和反式作用,最后,分析等位基因调控方式对杂种中基因表达遗传模式的影响,试图揭示杂种中基因表达调控的分子机制。主要结果如下:1.园艺学性状调查分析显示单球重相比于其他园艺学性状中亲值和超亲值较高,即产量杂种优势较为明显,RNA-seq技术分析发现两个F1代与各自母本之间的差异表达基因明显少于其与各自父本之间的差异表达基因,表明F1代的基因表达谱与母本更相似,火山图和MA图分析F1与其各自父母本之间的差异表达基因发现上调基因的差异倍数明显高于下调基因,表明上调基因在基因差异表达中起主要作用。2.差异基因通路富集分析发现杂种与亲本之间的差异基因主要参与生长发育(Biological process)、碳水化合物转运和代谢(G)、信号转导(T)以及氨基酸的合成、转运和代谢(E)等过程,这些生物学功能或代谢通路中包含叶球生长发育相关转录因子。可变剪接分析发现81%以上的可变剪接事件为第一个和最后一个外显子可变剪切(TSS和TTS),其次为单内含子滞留(IR),其他可变剪接事件所占比例较少。3.杂种F1代基因表达遗传模式分析表明母本表达水平显性占主要地位,其次为父本表达水平显性,加性表达数量最少。等位基因特异表达(ASE)分析发现顺式和补偿作用分别在HY1和HY2中占主要地位,反式作用对基因表达差异的贡献相比顺式调控作用更大,表明顺式和反式作用在调控杂种基因表达中的重要作用。4.杂种HY1等位基因变异分析表明一个基因组等位基因表达往往由另一个基因组的反式作用因子的不对称效应引起,基因表达遗传模式由父本和母本基因组等位基因上调和下调的特定组合所决定。基因表达遗传模式中的相对等位基因表达(RAE)和ASE分布表明两个杂交种中任一基因表达模式下RAE分布的不平衡性以及顺式和反式作用共同参与基因表达变异过程。
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