在我国医药卫生体制改革中公立医院改革不仅是重点,更是难点,公立医院改革的成功,也决定着其他医疗卫生体系的建立和配套政策的落实。在我国,人民群众看病的主要场所就是公立医院,所以,公立医院实现公益性,是充分保障人民群众身体健康切身利益的关键之所在,更是实现国泰民安的重中之重。本文就探讨公立医院回归公益性改革中的政府职能问题进行了研究。对公立医院的公益性进行了界定；对目前我国公立医院公益性淡化中政府职能的缺失进行了发掘；运用公共产品理论、政府失灵理论对公立医院公益性现状及国内外公立医院的运行机制进行了分析,提出了基于公立医院公益性的运行机制设计原则,在对公立医院运行机制影响因素进行了分析后,提出了基于政府失灵理论,提出了相关的策略,政府在采用市场的自由化纠正政府失灵中的作用,初步构建适合我国国情的公立医院运行机制的基本框架。希望通过本文的研究,可以为完善我国卫生组织体系、回归公立医院公益性,更重要的是缓解百姓“看病难、看病贵”的民生问题而建言献策。