科技创新是地区经济发展和获取竞争优势的内在驱动力,知识产权保护制度建立与完善,为中国科技创新活动提供重要的制度环境保障。知识产权保护具有明显的省域差异性特征,各省域科技创新情况也存在较大差异,因此,本文以中国31省市为对象,研究知识产权保护制度背景下各省域科技创新效率及其影响因素,以期确定最优知识产权保护强度,最大限度的提升省域科技创新效率。本文首先对国内外科技创新的有关研究进行了总结评述,发现在考虑知识产权制度下,国际技术溢出因素对国内省域科技创新效率的影响凸显,从而构建了知识产权保护环境下省域科技创新系统。其次,通过知识产权保护环境下省域科技创新系统构建并筛选出省域科技创新效率评价指标体系,并利用DEA-Malmquist指数法,对中国省域31个省市2001-2014年科技创新效率进行横向与纵向综合评价,结果表明考虑知识产权保护的DEA相对效率值普遍低于未考虑的DEA相对效率值,省域科技创新效率存在差异。再次,通过以知识产权保护为门限变量,构建科技创新效率影响因素的门限面板模型,模型分析结果表明,国际技术溢出因素对省域科技创新效率的影响受知识产权保护的双重门限影响,专利申请授权量、技术市场合同成交额、R&D经费投入强度与科技创新效率呈正相关,R&D人员全时当量与其呈负相关。因此,通过加强知识产权保护、优化创新资源配置效率、加快建设科技创新平台、提高政府对外资流向引导能力、提高对国际技术溢出的转化吸收能力等途径,结合各省域实际发展阶段,提高省域科技创新效率。