猪肠道与呼吸道微生物菌群不仅对宿主的生理、健康有着重要作用，同时也是重要微生物资源的来源，因此对猪肠道与呼吸道细菌的分离鉴定就显得尤为重要，本研究利用16S rRNA序列分析方法对猪源肠道与呼吸道细菌进行了鉴定。根据细菌的生长特性和形态学观察，从猪肠道粪便样品中共分离到126株细菌。设计细菌16S rRNA基因通用引物对其中的11株细菌进行了PCR和16S rRNA序测定，并对测序结果进行BLAST比对分析。结果表明：11株细菌包括2株柠檬明串珠菌、1株鼠乳杆菌、1株唾液乳酸杆菌、1株类肠膜魏斯氏菌、2株融合魏斯氏菌、2株洛菲氏不动杆菌和2株粪肠球菌。对这些细菌的生长特征和菌体特征进行系统的鉴定和分析。11株细菌中，柠檬明串珠菌、鼠乳杆菌和唾液乳酸杆菌是肠道益生菌，粪肠球菌和洛菲氏不动杆菌是条件致病菌，类肠膜魏斯氏菌和融合魏斯氏菌是在猪体发现的新型细菌。药敏试验结果显示，洛菲氏不动杆菌M8对阿莫西林、磺胺嘧啶、头孢类等多种抗生素敏感，但对环丙沙星耐药；而粪肠球菌M11对利福平、利奈唑胺、万古霉素敏感，对阿莫西林、红霉素、环丙沙星等其他多种抗生素耐药。通过细菌的生长特性和形态学观察，从176份有肺炎症状猪的肺脏病料组织中分离出82株细菌。设计细菌16S rRNA基因通用引物对其中25株细菌进行了PCR和序列测定，并对测定序列进行了BLAST比对分析。结果表明：25株细菌中包括1株粪肠球菌；2株卡他莫拉氏菌；3株猪链球菌；2株短杆菌；6株动性杆菌；1株嗜冷杆菌；1株绿色气球菌；1株产低温脂肪酶菌；3株芽孢杆菌和5株红斑丹毒丝菌。对这些细菌的菌落生长特征和菌体特征进行了系统鉴定和分析。25株细菌中，芽孢杆菌是益生菌，粪肠球菌、卡他莫拉氏菌和绿色气球菌是条件性致病菌，猪链球菌和红斑丹毒丝菌是致病菌，而短杆菌、动性杆菌、嗜冷杆菌和产低温脂肪酶菌都是在猪体发现的新型细菌。红斑丹毒丝菌ER4和卡他莫拉氏菌S7的生长曲线结果符合细菌生长规律，红斑丹毒丝菌ER4在菌液浓度为1.89×109时生长速度达到最大，而卡他莫拉是菌S7在菌液浓度为2.329×1010时生长速度达到最大。小鼠致病性试验结果表明，红斑丹毒丝菌具有较强的毒力。本研究经16SrRNA基因序列分析方法鉴定的36株细菌，其中，柠檬明串珠菌、鼠乳杆菌、唾液乳酸杆菌和芽孢杆菌是肠道益生菌，粪肠球菌、洛菲氏不动杆菌、卡他莫拉氏菌、绿色气球菌是条件致病菌，猪链球菌和红斑丹毒丝菌是致病菌，类肠膜魏斯氏菌、融合魏斯氏菌、短杆菌、动性杆菌、嗜冷杆菌和产低温脂肪酶菌都是在猪体发现的新型细菌。本研究验证了基于16S rRNA基因的PCR扩增和测序技术在鉴定猪源肠道与呼吸道细菌的可行性，同时获得了多株致病菌、条件性致病菌以及多株新型细菌，为进一步研究该类细菌的生物学特性等奠定了基础。