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本研究以探究绵羊卵巢卵泡期与黄体期的差异为研究设计出发点，设计了实验组湖羊卵泡期下丘脑、垂体、卵巢和对照组湖羊黄体期下丘脑、垂体、卵巢以及实验组湖羊下丘脑、垂体、卵巢和对照组脂尾羊下丘脑、垂体、卵巢这两组实验。对比组合如下：1.卵泡期湖羊下丘脑（HAF）：黄体期湖羊下丘脑（HAL）；2.卵泡期湖羊垂体（PAF）：黄体期湖羊垂体（PAL）；3.卵泡期湖羊卵巢（OAF）：黄体期湖羊卵巢（OAL）；4.卵泡期脂尾羊卵巢（OZF）：黄体期脂尾羊卵巢（OZL）；5.卵泡期湖羊卵巢（OAF）：卵泡期脂尾羊卵巢（OZF）；6.黄体期湖羊卵巢（OAL）：黄体期脂尾羊卵巢（OZL）。结果显示，HAF文库获得Clean Reads共17145814条；HAL文库获得Clean Reads共16353892条；PAF文库获得Clean Reads共17700558条；PAL文库获得Clean Reads共12984127条；OAF文库获得Clean Reads共20855404条；OAL文库获得Clean Reads共23333226条；OZF文库获得Clean Reads共14669930条；OZL文库获得Clean Reads共22745168条。
经差异分析，HAF：HAL组鉴定到64个差异表达miRNA；OAF：OZF组鉴定到14个差异表达miRNA；OAF：OAL组鉴定到43个差异表达miRNA；OAL：OZL组鉴定到40个差异表达miRNA；OZF：OZL组鉴定到7个差异表达miRNA；PAF：PAL组鉴定到5个差异表达miRNA。
经过生物信息学分析，差异表达miRNA富集到AMPK、PI3K、Wnt、Steroid hormone biosynthesis、Salivary secretion、PI3K-Akt、p53signaling、Notch、Melanogenesis、MAPK、Hippo、GnRH、Cell cycle和cAMP等信号通路。此外，经过miRNA-mRNA-通路联合分析，鉴定oar-miR-150、oar-miR-21、oar-miR-10a、oar-miR-10b、oar-miR-133、oar-miR-26b、oar-miR-19b、oar-miR-218a、oar-miR-494等为绵羊繁殖相关候选miRNA。
综上所述，通过高通量测序，成功获得了不同繁殖状态/相同状态不同繁殖力绵羊性腺轴器官的miRNA信息，并通过生物信息学确定一批繁殖相关的miRNA，为进一步开展绵羊分子育种提供参考依据。
经差异分析，HAF：HAL组鉴定到64个差异表达miRNA；OAF：OZF组鉴定到14个差异表达miRNA；OAF：OAL组鉴定到43个差异表达miRNA；OAL：OZL组鉴定到40个差异表达miRNA；OZF：OZL组鉴定到7个差异表达miRNA；PAF：PAL组鉴定到5个差异表达miRNA。
经过生物信息学分析，差异表达miRNA富集到AMPK、PI3K、Wnt、Steroid hormone biosynthesis、Salivary secretion、PI3K-Akt、p53signaling、Notch、Melanogenesis、MAPK、Hippo、GnRH、Cell cycle和cAMP等信号通路。此外，经过miRNA-mRNA-通路联合分析，鉴定oar-miR-150、oar-miR-21、oar-miR-10a、oar-miR-10b、oar-miR-133、oar-miR-26b、oar-miR-19b、oar-miR-218a、oar-miR-494等为绵羊繁殖相关候选miRNA。
综上所述，通过高通量测序，成功获得了不同繁殖状态/相同状态不同繁殖力绵羊性腺轴器官的miRNA信息，并通过生物信息学确定一批繁殖相关的miRNA，为进一步开展绵羊分子育种提供参考依据。