在国家战略指导思想下，科技协同创新正在成为区域经济增长的重要战略支点。作为沟通不同创新主体的关键桥梁和重要平台的科技协同创新平台，其运行绩效严重影响着科技协同创新的过程开战和成果转化等一系列重要问题，那么如何考核科技协同创新平台的运行效果，如何科学客观的评价科技协同创新平台运行绩效，真正指导和考察科技协同创新平台的高效建设与运行，就需要一套行之有效的绩效评价体系来实现。本文以科技协同创新平台运行绩效评价指标体系的设计及测度方法的构建为核心。首先阐述了科技协同创新平台运行绩效评价理论基础，并分析了科技协同创新平台的种类和运行模式以及评价平台运行绩效水平的哪些方面。在设计评价指标体系过程中，先运用逻辑框架法、文献法等方法建立指标体系框架，从平台的协同服务数量、协同服务成效、协同运行管理及协同资源整合四个方面对其进行评价，再通过文献研究法编写、筛选指标，最后咨询专家的建议对指标体系进行完善、修改。评价模型的选择上采用了云模型，依据评价指标体系，结合评价模型，进行了完整的实证分析。本文跟随国家着力推进科技协同创新发展的要求，建立一套具有普遍适用意义且能满足科技协同创新平台绩效有效评价的评价体系，使其在理论研究和实际应用上都能发挥较好的作用，给科技协同创新填补研究的空白。同时，选择云模型作为评价模型，使具有模糊性、随机性的信息能够得到更好的处理，且能够满足协科技协同创新平台运行绩效评价特点，从而使评价结果更加科学客观和实际建设需要。