金纳米颗粒包括纳米晶体和纳米团簇,在许多生物医学领域它都展示出了巨大的潜力,比如其在药物输送,疾病诊断和治疗剂合成上的应用。为了提高金纳米颗粒悬浮稳定性,金纳米颗粒经常被各种各样的修饰物所保护,比如烷烃硫醇,DNA链和多肽。这些修饰物还可以提高金纳米颗粒的生物相容性和调节金纳米颗粒的表面性质。最近,多肽修饰的金纳米颗粒获得了人们越来越多的兴趣。这些多肽修饰的金纳米颗粒不仅拥有卓越的生物相容性,而且多肽能够赋予金纳米颗粒额外的功能。比如,特定多肽序列修饰的金纳米颗粒可以作为诊断用的分子探针与某些疾病相关的蛋白特异性结合,另外,多肽修饰物还能够帮助金纳米颗粒穿过细胞膜。本文中用分子动力学模拟的方法研究了被9条十三肽所修饰的Au25团簇的结构及其和硫氧还蛋白还原酶1型(Trx R1)的相互作用。首先,进行了200 ns的模拟来研究多肽修饰的金纳米团簇(Au NC)在溶液中的结构。通过计算Au NC的回转半径和均方根偏差,刻画了Au NC表面多肽的分布和结构的情况。然后,为了研究Au NC是否能够和Trx R1结合以及Au NC可能的结合方式,本文模拟了5条至少50 ns的独立的轨迹。本文选取了一条具有代表性的轨迹来进行研究,通过计算Au NC中金原子质心和Trx R1活性位点处Cys497、Sec498质心的距离以及Trx R1和Au NC的接触原子数,来分析Au NC和Trx R1结合的稳定性和特异性。除此之外,文中还使用分子对接的方法研究了Au NC和Trx R1结合的情况。