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天然免疫是机体在进化中形成的古老免疫系统,构成机体抵御病原生物入侵的第一道防线。病原入侵后,天然免疫系统识别病原,产生细胞因子,同时激活炎症反应。适当的炎症反应反有利于杀死、清除病原体,促使组织损伤愈合,但过度的炎症反应则导致疾病的发生,甚至死亡。miRNA通过靶向编码基因mRNA3UTR,在转录后水平上对基因表达进行调控。目前的研究证明,miRNA参与天然免疫系统的多个环节,包括免疫细胞分化、发育,TLR受体基因表达,胞内TLRs信号转导,细胞因子生成、分泌,病毒感染、复制等。在病原感染时,miRNA不仅是重要的天然免疫活化后的信号调节分子,而且能够直接参与机体清除病原的过程。深入理解miRNA对天然免疫的调控作用有助于调节机体免疫应答和维护免疫平衡,控制过度的免疫反应,引导炎症反应向着有利于动物健康方向发展。本研究以小鼠为动物模型,首先腹腔注射LPS构建全身系统性炎症综合症(systemic inflammatory response syndrome,SIRS)小鼠,从基因学水平比较SIRS小鼠与对照小鼠脾脏微小RNA(miRNA)表达谱,获得LPS效应miRNA基因;其次,结合miRNA靶基因预测和表达谱分析确定对LPS所引起的炎症反应有调节作用的基因microRNA-1224(miR-1224)。然后检测了miR-1224对炎性基因TNFα、IL1β生成,以及对NF-κB转录活性的作用,以验证miR-1224是否参与了LPS/TLR4信号通路和对炎性基因生成的影响。最后,检测了miR-1224对靶基因偶联荧光素酶活性、靶基因表达的干扰作用,探讨miR-1224对LPS/TLR4信号通路调控作用的分子机制。
(1)成功构建内毒素所致小鼠SIRS模型。
采用腹腔注射LPS的方法,诱使小鼠出现SIRS/MODS症状。组织病理学检查结果显示,SIRS小鼠肝、脾、肺、肾均可见充血水肿、炎性细胞浸润、组织结构坏死。与对照相比,SIRS小鼠肝、脾、肺、肾中TLR4、IL-1β和TNFα基因表达量在注射后6h、12好、均发生明显改变。TLR4基因在脾、肺中表达量呈现震荡-升高的趋势,mRNA水平在6h下降后,12h后都显著升高(P<0.05),尤其在肺中,TLR4的表达量上升了64.5%。相对脾、肺,TLR4在肝中表达量不高,但当LPS刺激6h后,其mRNA水平上升45.9%。IL-1β在肝、脾、肺中表达量都急剧上升。在LPS刺激后6h和12h,IL-1β在肝中表达量分别上升5.68倍和13.1倍,而在脾上IL-1β水平呈现先高后低的事态:6h后生生3.69倍,12h后下降至65.8%。IL-1β在LPS刺激后的肺中表达则呈现先降低后升高的趋势:在6h后,IL-1β水平下降至检测极限,而12h后又较之对照上升4.39倍。在应答LPS刺激过程中,其在这四个组织中表达呈现不同趋势。LPS刺激后,TNFα在肝中表达持续下降,至12h时下降超过50%;在脾上,6h后达到高峰,12h下降低于对照水平;而在肺中,TNFα基因持续上升,12h上升7.9倍。
(2)获得19个LPS效应miRNA,画出miRNA-mRNA相互作用图,网络解析miRNA在应答LPS刺激过程作用及潜在的分子机制。
使用microRNA表达谱芯片比较LPS注射小鼠和对照小鼠的脾脏的miRNA表达变化,结果发现在LPS注射小鼠脾脏中有19个miRNA表达量上调。其中miR-146b、miR-155、miR-494和miR-1224最大变化倍数分别为1.61、2.75、4.17和5.75倍。用Stem-loop real-time PCR检测试验样品中这四个miRNA水平,发现其变化趋势跟芯片结果一致。用生物信息学分析差异表达miRNA,预测到1781个靶基因。对这些靶基因进行功能聚类分析(GO分析),结果显示与LPS信号转导和应答过程直接相关基因有169个,包括MAPK信号转导通路基因57个,Jak-STAT信号转导通路基因26个,细胞因子-受体相互作用通路基因34个,钙离子信号转导通路基因27个,趋化因子信号转导通路基因25个。根据靶基因预测与GO分析,获得miRNA-mRNA网络式的相互作用图,解析miRNA潜在的作用机制。根据这张图,我们推测miR-1224在应答LPS刺激中可能起负反馈调节作用。
(3)miR-1224负调控TNFα、IL-1β、IL-6表达,但不是通过调节NF-κB转录活性而实现的。
在小鼠类巨噬细胞RAW264.7细胞系中,过表达miR-1224导致TNFα、IL-1β、IL-6 mRNA明显表达下降,而功能缺失miR-1224时TNFα、IL-1β、IL-6mRNA水平高于对照细胞。表明miR-1224负调控TNFα、IL-1β、IL-6 mRNA。这验证了前面我们的推测。有趣的是,在RAW264.7细胞中过表达miR-1224,NF-κB转录活性高于对照,表明miR-1224正调节NF-κB转录因子的活性,同时也说明miR-1224对TNFα、IL-1β、IL-6基因表达的负调控作用不是通过调节NF-κB转录因子活性而实现的。
(4)miR-1224靶向调节Sp1蛋白。
HEK293细胞中共转染miR-1224 mimics和携带SP13UTR序列的融合质粒psicheck2-SP13UTR,荧光素酶活性比对照下降64%。RAW264.7细胞中转染miR-1224 mimics,检测SP1 mRNA水平和蛋白水平;Real-time PCR和westem blot结果表示miR-1224在转录后水平靶向调控SP1基因。
(5)成功构建、纯化腺病毒介导的miRNA前体表达载体。
在HEK293细胞中共转染pCD-pre-mir-1224融合质粒和腺病毒骨架治理,转染6天后出现CPE,12天后CPE增多,大部分细胞变圆脱落,反复冻融法收毒(P1代)。用P1代重组腺病毒复感染HEK293细胞,扩大培养,收毒后氯化铯梯度离心纯化腺病毒颗粒。用针对病毒基因组的PCR和针对感染病毒HEK293细胞总RNA的RT-PCR验证病毒正确性和活力。