骨折相关感染5种常见致病菌MqPCR检测方法的初步建立

来源 :青海大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:vuip
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:骨折相关感染(fracture-related infection,FRI)是创伤外科术后常见的严重并发症,也是骨折手术后最难治疗的挑战之一。组织培养法是临床上识别病原体最常见的检测方法,但因其培养时间长、结果易受影响等缺点,制约手术后快速精准用药。因此,我们旨在利用FRI中的常见致病菌,建立一种简便、快速的实用性的多重PCR检测方法,用于临床FRI检测。目的:利用FRI中的常见致病菌,建立一种更为简便、快速的临床实用性的Taqman多重荧光定量(TaqMan multiplex fluorescent quantitative PCR,MqPCR)检测方法。方法:(1)通过文献调研与回顾性分析近两年青海省人民医院的FRI确诊结果,确定FRI常见的致病菌。(2)参考国内外相关文献,确定5种常见致病菌的特异基因。根据这些基因的特异序列设计引物与探针,构建标准质粒,建立检测5种常见病原菌的MqPCR方法。优化实验条件,验证该方法的特异性、灵敏性、重复性等方面。(3)利用组织培养法和MqPCR方法检测66例FRI临床样本和24例对照组样本的感染状况。分别计算两种检测方法的敏感性、特异性、阳性预测值(positive predictive value,PPV)、阴性预测值(negative predictive value,NPV)、Youden指数和ROC曲线下面积(area under the ROC curve,AUC),比较两种检测方法的检测效能。结果:(1)通过文献调研与回顾性分析近两年青海省人民医院260多例FRI确诊结果,发现金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis,SE)、铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)、大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)和阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae,EC)是FRI的常见致病菌。(2)依据国内外相关文献,5种常见致病菌的特异基因依次为金黄色葡萄球菌的nuc基因、表皮葡萄球菌的16S基因、铜绿假单胞菌的外毒素A基因、大肠杆菌的ECs1048基因和阴沟杆菌的Omp X基因。MqPCR法检测SA、SE、PA、E.coli和EC这5种质粒DNA时,发现扩增曲线只出现在各自的模板下,不同的病原菌之间没有出现交叉反应。同时,该方法的组内与组间变异系数(coefficient of variation,CV)均小于0.5%,有较好的重复性与稳定性。表明成功构建了5种常见病原菌的MqPCR方法。(3)在66例FRI病例中,组织培养法检测出63例(95.5%)阳性结果,MqPCR法检测出56例(84.8%)。24例对照组样本中,组织培养法检测出3例(12.5%)阳性结果,MqPCR法检测出4例(16.7%)。MqPCR法的敏感性为93.3%、特异性为66.7%,而组织培养法的敏感性和特异性分别为95.4%和87.5%。若只考虑感染了5种常见致病菌的病例,MqPCR法的特异性从66.7%变为90.9%,要高于组织培养法(87.5%)。结论:总而言之,基于TaqMan探针的MqPCR检测法具有定量准确、快速(<5小时)、自动化、简单和重现性好等优点。不仅如此,其检测性能可与组织培养法相媲美,有望在初步检测病原菌方面得到广泛的应用。
其他文献
从文化翻译的视角看,纪录片《普洱茶——时光在吟唱》既记录了中国特色茶文化,又介绍了云南区域文化。基于文化翻译理论及指导意义,分析了《普洱茶——时光在吟唱》字幕英译存在的主要问题,并从词汇层面和句子层面探析了文化翻译视角下的《普洱茶——时光在吟唱》英译策略,以期有效推动云南民族区域茶文化的对外交流和宣传,更好地推动中华文化“走出去”。
期刊
太阳能电池组件是光伏发电系统中的核心部件,在其生产制造过程中,受材料、工艺及生产环境的影响,不可避免地会产生各类缺陷,给传统的人工检测带来较大的挑战。而基于视觉检测方法具有高效率、高精度、非接触等显著优势,在工业检测领域逐步得到广泛应用。针对目前电池组件视觉在线检测领域中的不足,本文对关键的检测算法进行了研究,在此基础上构建了组件视觉检测系统并应用于生产现场。具体工作如下:(1)根据电池片缺陷的特
学位
显著性目标检测是指快速有效地提取出场景中人类感兴趣的目标区域。在过去,为了便于广泛的视觉应用,各种显著性目标检测(Salient Object Detection,SOD)模型生成的结果被直接应用于图像分割、编辑以及操作、视觉跟踪和用户界面优化等。这些应用程序之所以取得了前所未有的突破,很大程度上是因为大量像素级标注数据集的公开。然而,显著性目标检测模型的训练常常受到标注成本的限制。因此,降低样本
学位
睑板腺功能障碍是睑板腺的一种慢性、弥漫性疾病,是导致干眼症和眼睑炎等眼疾的重要原因。红外成像是目前临床上评估患者睑板腺形态最有效的方法。作为监测睑板腺功能障碍发展的重要指标,需要准确测量腺体缺失率和腺体形态。虽然红外成像可以采集完整的睑板腺,但容易受到低对比度的限制,而且通常腺体边界模糊、形状不规则且数量大、靠得近,形成分割任务的难点。尽管存在少量使用深度学习框架自动分割睑板腺的方法,但它们需要完
学位
目标检测在人脸识别、实例分割、人群基数和人体姿态识别等领域发挥着至关重要的作用。针对视频中单帧图像检测精度不高的问题,本文提出了一种基于关键点的目标检测算法Point-GAT;该算法使用快捷连接优化主干网络,解决网络深度增加带来的学习退化问题;同时使用反卷积和特征融合增强了小尺度目标的检测效果;最后提出了一种图分类方法MS-GAT,通过有向有权重图来映射类别之间的语义关系,达到了更好的分类效果,有
学位
本论文旨在解决有机相变材料导热性差及易泄露的问题,通过引入多孔支撑材料的方式,将有机相变材料有效封装在支撑材料中。选取具有多孔结构的石墨毡作为前驱体,对其进行不同方式的改性,最终通过向前驱体中引入生长碳化硅纤维的方法,获得可以有效提升相变材料导热性能及维持较高潜热的最佳改性基体。将改性基体与一元及二元相变材料分别通过真空浸渍的处理方法,可以获得性能优异的含一种相变材料的“一元复合材料”及含两种相变
学位
普洱茶作为云南特有的地理标志产品,历史悠久,品质优良,是云南重要的经济作物,也是促进云南经济社会发展的重要支柱产业。但“重品质、轻品牌”一直是制约云南普洱茶产业升级发展的桎梏。新时代下,普洱茶产业要想突破瓶颈,必须在政策的指引下,立足消费新常态,充分发挥特色品牌优势,采取溯“古”策略,发扬特色文化优势,传承匠心工艺,打造高端茶品牌,激发消费者对普洱茶品牌的文化认同和品牌认同。同时,实施赶“潮”策略
期刊
为了研究中草药复合添加剂对肉牛运输应激的效果,试验将30头健康的西门塔尔杂交肉牛随机分为对照组和试验组,每组15头,试验组按时服用中草药复合添加剂,分别于长途运输前后不同时间点进行直肠温度、平均日增重、血液生化指标和发病率的监测。结果表明:中草药复合添加剂可以稳定肉牛长途运输后的体温和血液生化指标变化,具有提高日增重和减少发病率的作用。说明中草药复合添加剂可以用于肉牛运输应激。
期刊
目的:依据STRAW+10分期系统,探究女性在生殖衰老过程中由于雌激素水平波动或下降是否会诱发敏感性皮肤的发作或使皮肤敏感性增高,以期为临床上处于-2期~+2期(绝经过渡期和绝经后期)敏感性皮肤或皮肤敏感性增高的女性的治疗提供新思路。方法:本研究选取的调查对象为2020年12月~2021年12月就诊于青海大学附属医院体检中心且符合STRAW+10分期标准应用范围的成年健康女性。本次研究方法采用智能
学位
目的:探讨能谱CT成像联合血清铁蛋白(Serum ferritin,SF)评估泡状棘球蚴病(Hepatic alveolar echinococcosis,HAE)肝脏铁沉积的价值以及其在不同Child-pugh肝功能分级下肝铁沉积的变化规律、Child-pugh分级评分的相关性,为临床HAE的综合治疗及肝功能评价提供新思路。方法:收集2019年9月至2021年11月间来青海大学附属医院就诊且经临
学位