芽变是柑橘等果树作物育种的重要变异来源之一,也是果树体细胞变异的重要类型。柑橘杂种类型多,枸橼、柚和宽皮橘等基本种之间可相互杂交而产生各种杂柑。芽变和杂交事件是柑橘进化和新品种选育的重要基础。芽变的分子机制还不太清楚,一般认为芽变在分子水平差异极小。探究转座子在不同芽变品种中的多态性,找到鉴别芽变品种的标记,有助于推进芽变机理的认识,为柑橘芽变育种提供理论依据。柑橘遗传背景高度杂合,研究转座子在杂种柑橘形成过程中的变化,有助于理解柑橘杂种材料基因组变异和种间进化关系。本课题在甜橙基因组的基础上,利用TD(transposon display)技术,先研究33个转座子在柑橘芽变品种中的多态性,后挑出20个来研究转座子在杂种柑橘及其亲本中的多态性,主要结果如下:1.筛选了33个高丰度的转座子用于芽变鉴别。18个DNA转座子中有5个(DTM63、DTM58、Helitron1、Spem和mPing2),15个反转录转座子有4个(Line1、LTR-Gypsy3、LTR-Gypsy5和Tcs2)能较好地鉴别柑橘成熟期、色泽、育性等性状变异的芽变品种。DNA转座子DTH3,在甜橙芽变品种中多态性高,表现活跃,但在供试温州蜜柑芽变品种中没有明显的多态性。2.罗伯逊脐橙及其早熟芽变罗脐35号中检测到较多转座子差异,能被DTM63,Spem和mPing2这些转座子鉴别开来。mPing2在柑橘芽变中表现活跃,能鉴别罗伯逊脐橙及罗脐35号、暗柳及红暗柳、普通椪柑及黔阳无核椪柑,以及红肉琯溪蜜柚与橙皮琯溪蜜柚这些芽变品种对。3.转座子作为标记不同程度地支持了柚和橘杂交产生酸橙,酸橙和枸橼杂交产生柠檬,柚和甜橙杂交产生葡萄柚以及橘和甜橙杂交产生克里曼丁橘这4个事件。20个转座子中有10个支持柚和橘杂交产生酸橙,支持率最高。4.柚、橘和酸橙以及柚、甜橙和葡萄柚这2个组合中,均检测到3个活跃的转座子,分别为:LTR-Copia1、Helitron1、MUDR2和DTM53、DTM63、MUDR2;MUDR2在这2个组合中都表现活跃。5.柚、甜橙和葡萄柚组合中,转座子表现各异:Spem片段丢失严重,Harbinger2和LTR-Gypsy1未丢失片段也没有发生转座,而MUDR2表现活跃,发生了新的转座。