黄曲霉（Aspergillus flavus）是一种遍布全世界的腐生真菌,能产生黄曲霉毒素（aflatoxin,AF）。AF是一组具有致癌性、肝脏毒性和免疫抑制效应的真菌毒素,严重威胁人类健康和粮食安全,每年给世界农业经济造成巨大的损失。槲皮素不仅能够抑制黄曲霉菌的生长,同时能够抑制黄曲霉毒素的合成。本研究基于RNA-seq技术分析槲皮素抑制黄曲霉生长及其毒素合成的可能机制,得到以下结论:第一,槲皮素能够抑制黄曲霉生长及毒素的合成。第二,采用RNA-seq技术分析槲皮素处理前后黄曲霉基因mRNA水平的影响。RNA-seq结果显示,黄曲霉样品表达转录本注释得到的基因有11308个,对所有能够比对上基因组的基因按|log2（fold change）|>1,Probability>0.8的条件筛选,共有665个差异表达基因。其中,槲皮素处理组黄曲霉表达上调的基因有340个,表达下调的基因有325个。差异表达基因GO和KEGG分析结果显示,差异基因主要富集到structural constituent of ribosome 和 structural molecule activity。第三,槲皮素抑制黄曲霉生长,主要与AFLA₀83110和AFLA₀44790两个与孢子发育相关的基因有关。第四,槲皮素抑制黄曲霉AF合成,主要调控了 aflS基因,但afrs在AF生物合成中的确切作用目前尚不清楚。