我国目前正处于经济转型时期,随着近年来新型工业化、新型城镇化进程的加快,人口老龄化、居民慢性病患病率大幅度上升,城镇居民对医疗资源需求显著增加。公立医院由于自身定位,长期以来一直在医疗服务市场中处于垄断地位。伴随着我国医疗体制市场化改革的深入,公立医院公益性逐渐淡化逐利性逐渐显现,暴露出许多问题:公立医院的利益导向偏离了公益性的组织目标;过于行政化的管理制度降低了医院的工作效率;居高不下的药品价格和各种名目的费用使得人民群众“看病难”;就诊流程繁琐,患者就诊满意度不高。本文以南京市公立医院管理创新为具体研究对象,首先分析了南京市公立医院管理创新的研究背景与意义,表明这项研究具备的现实意义和实用价值;随后通过梳理委托代理理论、新公共管理理论和管理创新理论的基本概念,为南京市公立医院管理创新提供了理论依据;接着选取南京市公立医院管理创新作为实证分析对象,以公立医院治理结构、医疗资源分布、药品采购模式、人事制度、就诊流程和信息化建设为突破口,研究南京市公立医院在当前发展中出现的问题;然后通过结合国内外公立医院管理创新案例,揭示了南京市公立医院发展策略中的优势、劣势、机遇与威胁,在此基础上选择适合南京市公立医院管理创新的策略;最终结合以上研究分析,分别从宏观和微观的角度,提出相应的管理创新对策。研究表明,南京市公立医院管理创新必须紧随新时期医疗改革的步伐,从宏观和微观两个角度入手,来对南京市公立医院进行管理创新:宏观上,政府需要明确“管办分离”改革中自身的职责范围,建立科学的公立医院法人治理结构,对南京市医疗资源进行合理分配,多角度对药品集中采购模式进行升级;微观上,公立医院自身需要响应去编制化的政策要求,制定科学的人事管理制度,积极利用大数据平台优化医院的诊疗流程,通过加强医院信息化建设来提高患者的就诊满意度。从而对南京市公立医院的管理制度进行创新,改善其管理环境,提高服务质量从而更好地为群众提供服务。