自然保护区作为一种公共资源存在,在对其进行使用和管理的过程中,不可避免的会遇到公地悲剧、外部性、市场失灵和政府失灵等一系列问题,归结起来,这些问题产生的根源在于权利和责任界定的不清晰,而自然保护区管理体制的完善与有效产权结构的构建过程正好是对权利和责任进行合理界定和分配的过程,因此,对于上述问题就存在两种可供选择的解决方式：一是有效产权结构的构建；二是管理体制的完善。但是由于自然保护区产权的运行是一个动态的过程,是权利的分配过程,而自然保护区管理体制是其产权运动的结果,所以有什么样的产权结构相应就会产生什么样的管理体制,而管理体制的不足往往也是由产权结构的不合理所造成的。鉴于此,笔者认为只有建立起明晰的自然保护区产权体系,配置有效率的产权结构,以有效率的自然保护区产权构造为前提和指导,才能构建起完善的自然保护区管理体制,才能从根本上解决自然保护区使用和管理中的弊端。本文首先从产权与公共资源管理的基本理论入手,对产权理论与公共资源管理之间的关系有一个清晰的认识,在此基础上对我国自然保护区产权结构现状进行分析,揭示出其中存在的问题,并指出自然保护区产权结构及其管理体制之间的关系,进一步得出完善自然保护区管理体制的关键在于构建有效率的自然保护区产权结构的结论,然后通过对自然保护区的相关权利进行重新配置,构建起有效的自然保护区产权结构,并以此为前提和指导,最终构建起完善的自然保护区管理体制。