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目的DNA启动子区CpG岛的异常甲基化是导致胃癌中抑癌基因功能失活的重要机制之一,参与了胃癌的发生发展。本研究通过联合应用甲基化特异性PCR法(MSP法)、亚硫酸氢盐修饰后测序法(BSP法)检测胃癌组织、癌旁组织和正常对照组织中p16基因、RUNX3基因和CHFR基因启动子区CpG岛的甲基化水平,探讨它们在胃癌发生发展中的作用以及与临床资料参数之间的联系。方法选择经病理确诊的61例原发性胃癌患者,胃癌患者术前均未行放疗和化疗,收集胃癌根治术后肿瘤组织及其配对的癌旁组织。同时收集30例胃正常对照组织,应用MSP方法和BSP方法检测标本中p16、RUNX3、CHFR基因启动子区CpG岛的甲基化水平。结果1. p16基因启动子区CpG岛的异常甲基化胃癌组织中甲基化阳性率为68.8% (42/61),癌旁组织为6.5% (4/61),而正常组织为3.3% (1/30),前组与后两组比较均有统计学意义(p<0.05)。低分化和未分化组胃癌组织的p16基因甲基化阳性率明显高于高分化和中分化组胃癌组织的甲基化阳性率;有淋巴结转移的胃癌组中p16基因甲基化阳性率显著高于无淋巴结转移组(p<0.05);胃癌中T3和T4期p16基因的甲基化阳性率显著高于T1和T2期的甲基化阳性率(p<0.05);而p16基因甲基化阳性率在患者的年龄、性别、病理分期、肿瘤大小、淋巴结转移数目中的差异均无显著性(p>0.05)。2. RUNX3基因启动子区CpG岛的异常甲基化胃癌组织中RUNX3基因甲基化阳性率为54.0% (33/61),癌旁组织为8.1% (5/61),正常组织为0% (0/30),前组与后两组比较有统计学意义(p<0.05)。RUNX3基因在≥5cm的胃癌组织中的甲基化阳性率显著高于其在<5cm的胃癌组织的甲基化阳性率(p<0.05),而其异常甲基化在患者年龄、性别、肿瘤浸润深度、组织分化程度、病理分期以及淋巴结转移等临床资料参数中的差异均无显著性(p>0.05)。3. CHFR基因启动子区CpG岛的异常甲基化胃癌组织中CHFR基因甲基化阳性率为40.9% (25/61),癌旁组织为9.8% (6/61),正常组织为0% (0/30),前组与后两组比较有统计学意义(p<0.05)。CHFR基因在≥5cm的胃癌组织中的甲基化阳性率显著高于其在<5cm的胃癌组织的甲基化阳性率(p<0.05),而其异常甲基化在患者年龄、性别、肿瘤浸润深度、组织分化程度、病理分期以及淋巴结转移等临床资料参数中的差异均无显著性(p>0.05)。4. p16和RUNX3基因之间、p16和CHFR基因之间以及RUNX3和CHFR基因之间在胃癌组织中的异常甲基化作用无显著相关性和一致性(p>0.05)。结论1.胃癌组织、癌旁组织均存在p16、RUNX3和CHFR基因启动子区CpG岛的异常甲基化作用,且它们在癌组织中的甲基化阳性率显著高于相应的癌旁组织,提示抑癌基因启动子区CpG岛异常甲基化在胃癌的发生发展中是早期和频繁的特异性事件,同时存在多个抑癌基因启动子区CpG岛的异常甲基化是胃癌发生的重要机制之一。2.从正常胃组织、癌旁组织到胃癌组织,p16、RUNX3、CHFR基因启动子区CpG岛异常甲基化阳性率逐渐增加,提示此三基因的异常甲基化可作为胃癌早期诊断的敏感指标。3. p16基因启动子区CpG岛异常甲基化与胃癌患者组织分化程度、有无淋巴结转移以及肿瘤浸润深度均密切相关,可作为评估胃癌组织分化程度、浸润深度、有无淋巴结转移的有效指标。4. RUNX3和CHFR基因启动子区CpG岛异常甲基化与肿瘤大小密切相关,它们的异常甲基化可用于评估胃癌细胞的生长。