本实验利用12个微卫星标记从分子水平对鸡、鹌鹑及其属间杂交种的遗传多样性进行研究,计算了杂合度、有效等位基因数、多态信息含量、群体间的遗传距离,并根据遗传距离对鸡、鹌鹑及其属间杂种进行了聚类分析。研究结果如下:(1)本研究12个微卫星座位上共检测到了66个等位基因,每个座位上的等位基因数为4～8个,有效等位基因数目为3～7个,有效等位基因数小于实际观察等位基因数,这是等位基因分布不均匀的结果。(2)属间杂交种共检测到54个等位基因,每个座位平均等位基因数为4.5个,该群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.6659和0.6800。(3)朝鲜鹌鹑共检测到55个等位基因,每个座位平均等位基因数为4.583个;该群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.6945和0.7111。(4)新罗曼蛋鸡共检测到40个等位基因,每个座位平均等位基因数为3.33个,该群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.5681和0.5977。(5)12个微卫星标记在三个群体中的多态信息含量除GUJ0063为中度多态外,其余11个微卫星均为高度多态,三个群体平均多态信息含量在0.5681～0.6945,平均杂合度在0.5977～0.7111。12个微卫星标记可作为有效的遗传标记用于鸡﹑鹌鹑及其属间杂交种遗传多样性研究。(6)计算了标准遗传距离,属间杂交种与朝鲜鹌鹑的距离最近,与新罗曼蛋鸡相对较远。