台湾问题一直是困扰中国政府的复杂问题，而政府间国际组织中的涉台问题也日益成为中国大陆政府和台湾地区关注的焦点。由于台湾地区参与政府间国际组织这一问题的特殊性与敏感性，使得中国政府在处理这一问题上面临诸多困难与障碍。　　 台湾地区参与政府间国际组织问题只是台湾问题的一个很小的组成部分，它受到诸多其他因素的影响，其最终解决也有赖台湾回归祖国，因此，必须综合多方因素对这一问题进行分析。　　 1971年10月25日，联合国2758号决议将台湾从联合国及与其相关的国际组织中驱逐出去，台湾地区的国际空间日益萎缩。自那时起台湾地区就开始了寻求重新参与国际组织的活动。在过去多年的争取国际空间的过程中，台湾当局运用多种策略与方法，并在一些领域取得了一些突破，而大陆方面也在国际舞台上与之展开了争锋相对的激烈斗争。随着2008年台湾地区政坛发生剧烈变动，国民党重新掌权。在马英九政府主张的“外交休战”政策下，台海关系进入一个新的和平发展阶段，从而也使得台湾地区参与政府间国际组织又有了新的发展和变化。而目前国内学术界对这一新情况的出现鲜有研究与关注，鉴于此，本文在对目前国内外相关研究进行详细梳理的基础之上，根据政府间国际组织自身特点以及国际组织中涉台问题的特点，将政府间国际组织按政治敏感度分为：(1)只准主权国家才能加入的纯政治性政府间国际组织(2)与联合国密切相关的半政治性组织国际组织(3)允许地区和其它团体加入的纯功能性政府间国际组织三大类进行分析论述。同时，运用案例分析法分别选取了这三类组织中最具代表性的联合国、世界卫生组织及世界贸易组织三个典型组织。对台湾参与这些组织的历史进行梳理分析，并结合各类组织的特点探析在台海关系步入和平发展时期之后，台湾地区如何在“一个中国”原则和“共同协商”原则之下进一步参与政府间国际组织，为之设计具体合理的可行路径。最后，对中国政府在处理政府间国际组织涉台问题上的相关政策进行总结，并分析现有政策的存在的问题及问题存在的原因，同时为大陆政府日后处理这一复杂问题提出相关建议与参考，以期为最终解决台湾问题，实现祖国统一贡献一点力量。