南瓜是人们最早栽培的重要经济农作物之一。裸仁南瓜又称无壳南瓜，是极其罕见的籽用南瓜品种，因成熟的种子没有坚硬的、白色的种壳，仅有薄薄的绿色的外膜包覆而得名。裸仁性状受一对隐性的主效基因及一些修饰基因控制，隐性基因决定坚硬种皮的有无，修饰基因则控制绿色薄膜的厚度。裸仁南瓜子不需要加工去皮，籽肉的获取和食用方便，在食物点缀中得到广泛应用。　　 本研究利用SSR分子标记技术对控制南瓜裸仁性状基因进行定位分析，以期获得与裸仁基因n紧密连锁的分子标记，为裸仁南瓜分子标记辅助选择育种提供理论依据。研究结果表明:　　 1.本研究选用以美洲南瓜裸仁品种0516-2自交系和美洲南瓜正常白板有壳品种金辉二号自交系为亲本材料，正反交组合F1代、F2代分离群体为实验试材。金辉二号×0516-2的F2种子表型性状经田间调查分离比率为3.3∶1，基本符合孟德尔分离定律，表明裸仁性状受一对隐性核基因控制。　　 2.利用亲本金辉二号和0516-2对500对SSR引物进行初步筛选，获得了多态性好的引物126对。利用126对引物对156株F2代植株进行多态性分析，统计数据，进行遗传距离的计算。　　 3.对F2群体进行分析，获得了4个与裸仁性状基因n紧密连锁的SSR标记，它们分别是CMTp264、CMTp85、CMTp165和CMTm15的遗传距离分别为5.7cM、10.7cM、12.2cM和15.7cM,　　 4.本试验筛选获得与美洲南瓜裸仁基因n紧密连锁的标记CMTp264，为将裸仁基因的精确定位和克隆、加快裸仁南瓜分子标记辅助选择育种工作奠定了重要的试验基础。