玉米大斑病菌转录因子StSte12的亚细胞定位、靶基因筛选及其表达规律分析

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yixvmei
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本课题组在前期研究中克隆了玉米大斑病菌Fus3/Kss1-homolog MAPK级联途径下游核心转录因子StSte12的基因,并获得了3株不同沉默程度的RNAi转化子,通过对转化子的分析发现,该基因参与调控病菌的致病过程,但其具体的调控的机制尚不清晰。本研究利用基因敲除及过表达技术获得了StSTE12基因敲除及过表达突变体,通过对突变体的分析,明确了该转录因子的亚细胞定位;利用生物信息学技术鉴定了可能受StSte12调控的几丁质合酶基因家族,并利用Real-time PCR技术发现其中3个基因可能受该转录因子的正调控;利用染色质免疫共沉淀技术确定了StSte12作用的靶基因,并明确了在该基因的结合位点。主要研究结果如下:  1.利用PEG介导的原生质体转化方法,将StSTE12基因过表达载体转化玉米大斑病菌野生型菌株01-23,通过草胺磷抗性筛选、GFP荧光检测、特异引物PCR及Real-time PCR验证,获得了2株StSTE12基因过表达突变体。  2.以pBS-pUC质粒为基本骨架,构建了玉米大斑病菌StSTE12基因敲除载体,通过PEG介导的原生质体转化方法转化野生型菌株01-23,通过潮霉素B抗性筛选、特异引物PCR及RT-PCR验证,筛选得到了2株StSTE12基因敲除突变体。  3.通过对StSTE12基因过表达突变体细胞内GFP荧光观察,并结合DAPI染色方法,确定了StSte12亚细胞定位于细胞核中。  4.利用生物信息学方法,在玉米大斑病菌基因组数据库中鉴定出几丁质合酶基因家族,该家族包含8个与几丁质合成相关的基因StCHS1-StCHS8;利用Real-time PCR技术分析了这8个基因在野生型菌株、StSTE12基因敲除及过表达突变体菌株中的表达情况,结果发现,与野生型菌株相比突变体中StCHS3、StCHS5、StCHS7基因的表达量均表现出显著差异,并且在StSTE12基因的敲除突变体中表达量显著降低,在过表达突变体中显著升高,表明这3个几丁质合酶基因很可能受StSte12转录因子的正调控。  5.利用染色质免疫共沉淀技术(ChIP)确定了StCHS5为受StSte12转录因子调控的靶基因;进一步利用qPCR技术对StCHS5的启动子区分析发现StSte12在该基因的结合位点序列为TGAAACG。  6.利用Real-time PCR的方法分析了玉米大斑病菌中几丁质合酶基因StCHS5在不同发育时期的表达情况,结果发现StCHS5基因在芽管、附着胞以及侵入丝时期表达量相对较高。
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