苹果果实色泽是评价果实商品性的关键指标,也关系着果实的营养保健功能,果实最终色泽主要由类胡萝卜素、叶绿素、花青素、类黄酮等色素的相对含量决定。苹果中类胡萝卜素研究时间短,研究基础薄弱,但类胡萝卜素对于苹果品质具有重要地位,因此对苹果类胡萝卜素合成相关基因表达的研究,将为高品质育种提供重要的理论依据。本文采用色差计测定苹果生长发育过程中色泽值,采用比色法测量类胡萝卜素及其他果皮色素含量,分析果皮色素、色差的变化及其相关性;通过采用多种苹果试材、选用多种方法进行RNA提取并进行质量检测,筛选出了适用于转录组测序的苹果果实RNA提取方法;对‘东北黄海棠’转色期前后果实进行转录组测序,对转录组数据进行验证,并分析果实发育过程中果皮、果肉类胡萝卜素合成相关基因表达量,结合类胡萝卜素含量变化筛选与类胡萝卜素代谢显著相关基因。本文的主要结果和结论如下:黄色种质‘东北黄海棠’、红色种质‘冬红果’、白色种质‘早白海棠’苹果发育过程中果皮类胡萝卜素、叶绿素、总酚和类黄酮整体呈降低趋势,类胡萝卜素、叶绿素在‘东北黄海棠’近成熟期含量略有上升;类胡萝卜素与叶绿素a、叶绿素b、总叶绿素、花青素、类黄酮、总酚以及L*值都有显著或极显著相关性;成熟期黄色种质‘东北黄海棠’果皮相对红色、白色种质苹果果皮的类胡萝卜素含量较高,达到22.73μg/g FW,并且黄色种质中类胡萝卜素与其他色素相关性较弱。以苹果叶片、不同发育时期果实为材料,采用7种不同的方法对4种材料进行RNA提取,并通过凝胶电泳、Agilent 2100 RNA芯片对提取的总RNA进行质量检测。结果显示7种方法中有2种可以成功提取4种材料的RNA,得出改良CTAB法是适合转录组测序的苹果果实RNA提取方法。对‘东北黄海棠’转色期前后果实进行转录组测序,经过数据的分析得出转色期前后果实差异表达基因共3056个,转色期后果实中有1270个基因上调表达、1786个基因下调表达。转色期后涉及光合作用基因下调最为显著,半胱氨酸、蛋氨酸代谢和苯丙素合成基因上调数量较多,涉及类胡萝卜素合成途径的差异表达基因有7个。对该7个基因进行荧光定量PCR验证;采用苹果资源‘东北黄海棠’‘吉林小黄海棠’‘华月’的两个时期果实,以及检测3个种质两个时期果实类胡萝卜素含量,分析得出MdPSY2、MdCCD4a、MdCCD4b基因对类胡萝卜素含量影响显著;以‘东北黄海棠’‘晚白海棠’2个种质20DAFB果实以及50DAFB、90DAFB、成熟期果皮、果肉为材料进行转录组数据验证,检测类胡萝卜素合成相关基因表达量检测和类胡萝卜素含量,以及‘东北黄海棠’‘晚白海棠’4个时期果实为材料检测类胡萝卜素降解基因CCD4的相对表达量,综合得出类胡萝卜素的在苹果果实中的积累量受MdPSY2、MdCCD4a、MdCCD4b基因影响较大。