我国从古至今都在有计划地对长距离引水工程进行规划和建设，这些工程因其距离长、规模大、技术复杂、涉及领域多等特点给管理部门在处理突发公共事件时提出了严峻的考验。2006年，国务院下发了《关于全面加强应急管理工作的意见》的通知，对各个行业、各个单位的应急管理工作提出了更高的要求。21世纪的管理将向协同化的方向发展，本文将协同论的思想引入到长距离引水工程突发公共事件应急机制的研究中，主要内容包括以下几个方面：（1）研究了长距离引水工程突发公共事件应急机制的协同内涵，给出了协同合作的概念并分析了其系统的协同特征。根据协同论序参量的定义和特征，揭示出贯穿于整个应急管理系统的若干序参量；（2）对协同合作的必要性进行论述，通过对协同学基本演化方程的转换，引入Logistic曲线方程分析了单边协同和两两协同两种模型，明确了两个子系统的协同构建机理；（3）结合某长距离引水工程的实际情况，明确了机构职责，编制了响应程序，提出了应急响应保障措施。