民营科技企业孵化器在促进科技成果转化、完善我国孵化器结构、弥补国家建设资金不足、为国有科技企业孵化器改革提供借鉴等方面正发挥着重要作用。但由于其是新生事物,政府目前对其多为应急式、被动式管理,同时也出现了一些管理问题。本文从民营科技企业孵化器产生的动力机制及其运行机制入手,全面分析了国有、民营两类孵化器的优势与不足,就现阶段政府管理问题剖析其产生的主观与客观原因。在此基础上,对政府管理民营孵化器从不同角度进行了全面思考,首先指出科技企业孵化器服务产品的性质是准公共产品,这种产品可以也应该部分由民间资本投资生产,其提供的规模主要考虑产品的外部经济性,政府应给予民营孵化器同等地位,同时认识并防范其运作风险。随后,本文分析了政府在民营孵化器建设中的作用,对民营孵化器内生的矛盾——公益与私利关系进行了全面剖析,认为现阶段矛盾实际表现为民营孵化器实力不足与满足三大公益性目标要求之间的矛盾。接着指出了政府管理的途径与方法,最后提出政策建议。本文在第六章分析了政府服务与监管要素,服务要素包括服务组成要素和服务操作要素,监管要素指出了监管的关键点。本文最后对长沙市管理民营孵化器进行了案例分析。