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齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)是我国特有的重要冷水性经济鱼类之一。近十年来,随着鱼类疾病的不断爆发,从而引起经济的大量损失。加强对齐口裂腹鱼的发病机制的研究,为其提升防病技术和健康养殖有十分重要的意义。Toll样受体(Toll-like receptors, TLRs)是鱼类机体抗感染的第一道防线,它是通过识别病原体中的保守病原分子模式来起作用。本研究利用RT-PCR (Reverse Transcript-Polymerase Chain Reaction,反转录聚合酶链式反应)克隆并分析了齐口裂腹鱼TLR途径中的MyD88(myeloid differentiation primary response gene88,髓样分化因子88)和IRF3(interferon regulatory factor3,干扰素调节因子3)的部分cDNA (Complementary DNA,互补DNA)序列,并利用RT-PCR技术研究了它们在齐口裂腹鱼不同组织的表达谱,结果如下：(1)MyD88基因cDNA序列518bp,共编码172个氨基酸。通过NCBI网上Blast后发现已获得的齐口裂腹鱼MyD88序列与鲤鱼(Cyprinus carpio)和斑马鱼(Danio rerio)呈现96%和93%的一致性。使用MEGA5.1软件,根据GenBank上已注册的MyD88的氨基酸序列以邻位相连法构建进化树,分析表明,齐口裂腹鱼与其他鱼类MyD88占据进化上树独立的分枝,而鸟类与哺乳动物各自聚为一个亚群形成另外的分枝,与传统的分类方法所得的结果一致,齐口裂腹鱼在进化关系上与同科的斑马鱼和鲤鱼最近；(2)IRF3基因序列586bp,共编码193个氨基酸。BLAST分析表明,该片段与GenBank中已知的鲤鱼MyD88基因有77%的相似性,与金鱼的MyD88基因有68%的相似性。进化树分析表明,齐口裂腹鱼与其他鱼类IRF3占据进化上独立的分枝,鸟类和哺乳动物各自聚为另外的分枝,齐口裂腹鱼在进化关系上与鲤鱼最近；(3)采用RT-PCR技术分析了MyD88和IRF3在齐口裂腹鱼不同组织的表达谱,发现MyD88在齐口裂腹鱼脾脏、肝脏、肌肉、鳃、肠、肾和血液中都有表达,在脾脏和肝脏中表达量最高：IRF3在齐口裂腹鱼的组织中的表达呈现广谱性,并且在肝脏中表达最高,肌肉表达最低。嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)诱导后,齐口裂腹鱼MyD88基因在脾脏和IRF3基因在肝脏中的表达量变化显著。本研究将为深入了解齐口裂腹鱼免疫机制提供理论依据,并进一步了解长江上游流域冷水性经济鱼类的免疫机制及高效健康养殖鱼类的选育及培育奠定基础。